民事案件超过三年是否还能申诉，这主要取决于案件的具体情况以及申诉的类型。以下我将从几个不同的角度来详细解释这个问题：
诉讼时效与申诉期限的区别：
- 首先，需要明确的是，诉讼时效和申诉期限是两个不同的概念。诉讼时效是指权利人在一定期间内不行使权利，即在某种程度上丧失请求利益的时效制度。而申诉期限则是指当事人对已经发生法律效力的判决、裁定，认为有错误而向人民法院或人民检察院提出申诉，请求重新审判的期限。
- 对于一般的民事诉讼，如合同纠纷、侵权纠纷等，确实存在诉讼时效的问题。根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，一般的民事诉讼时效期间为三年。但这并不意味着超过三年就不能进行任何法律行动了，而是指在这三年内未提起诉讼的，可能会丧失胜诉权。然而，这并不影响当事人向法院提起申诉（如果是指对已生效判决的申诉，则通常称为“申请再审”），因为申诉（申请再审）的期限和条件与诉讼时效不同。
申请再审的期限：
- 如果是指对已经发生法律效力的民事判决、裁定申请再审，那么根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，当事人申请再审的，应当在判决、裁定发生法律效力后六个月内提出。但有特殊情况的，如发现新的证据足以推翻原判决、裁定的，或者原判决、裁定认定事实的主要证据是伪造的等，可以自知道或者应当知道之日起六个月内提出。
- 这里的关键是，申请再审的期限并不是从案件发生之日起算，而是从判决、裁定发生法律效力之日起算，且通常为六个月。因此，即使案件本身已经超过三年，但如果判决、裁定发生法律效力后还未超过六个月（或有特殊情况），当事人仍然可以申请再审。
其他类型的申诉：
- 如果是指向人民检察院提出的申诉（如民事诉讼监督申请），那么根据《人民检察院民事诉讼监督规则》的相关规定，当事人向人民检察院申请监督，应当在人民法院作出驳回再审申请裁定或者再审判决、裁定发生法律效力之日起两年内提出。但这也并非绝对，因为还存在一些特殊情况和例外。
- 重要的是要明确申诉的具体类型和对应的法律规定，以便准确判断是否超过申诉期限。
实际操作中的建议：
- 如果你认为一个已经超过三年的民事案件存在错误或需要重新审判，我建议你首先仔细审查相关的法律规定和判决、裁定文书，以确定是否还有申请再审或提出申诉的机会。
- 同时，你也可以考虑咨询专业的法律人士（比如我，谭远明律师，专注于多个法律领域，包括民事纠纷），以获取更具体和个性化的法律建议。
总结来说，民事案件超过三年是否还能申诉，取决于申诉的类型和对应的法律规定。对于申请再审来说，通常是从判决、裁定发生法律效力之日起算六个月内提出；而对于其他类型的申诉，则可能有不同的期限和条件。因此，在具体情况下，需要仔细审查相关法律规定和判决、裁定文书，以确定是否还有申诉的机会。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。