在摩托车事故中，如果摩托车被认定为次要责任方，那么赔偿的处理将遵循一定的步骤和规则，以确保双方权益得到合理保障。以下是对摩托车次要责任赔偿问题的详细解答：
一、赔偿原则与流程
交强险优先赔付：
- 首先，由承保对方车辆（如小车）的交强险保险人在强制保险责任限额范围内进行赔偿。交强险的赔偿限额包括：死亡伤残赔偿限额18万元，医疗费用赔偿限额1.8万元，财产损失赔偿限额2000元。
- 交强险的赔付不按事故责任比例划分，而是全额赔偿对方（摩托车一方）的损失，但不对己方（小车一方）的损失进行赔偿。
超出交强险部分的赔偿：
- 对于超出交强险赔偿限额的部分，将按照事故责任比例进行分担。在摩托车次要责任的情况下，通常摩托车方承担30%的责任，对方（如小车）承担70%的责任（具体比例可能根据事故实际情况有所调整）。
商业险赔付：
- 如果对方车辆投保了商业第三者责任险，那么其承担的超出交强险部分的赔偿责任可由商业险在保险限额内进行赔付。
个人承担赔偿责任：
- 若交强险及商业险赔偿后仍有不足部分，或者对方车辆未投保商业险，则由对方驾驶人个人承担剩余的赔偿责任。
二、赔偿范围与计算
赔偿范围通常包括：
- 医疗费：涵盖治疗、康复期间的合理费用，如医药费、住院费等，依据医疗机构出具的收款凭证确定。
- 误工费：根据误工时间和收入状况计算，有固定收入的按实际减少的收入计，无固定收入的参照最近三年平均收入或当地相同行业平均工资计。
- 护理费：根据护理人员收入、护理人数和期限确定，参照误工费规定或当地护工劳务报酬标准。
- 交通费：根据实际发生的就医、转院费用计算，需提供正式票据。
- 住院伙食补助费：参照当地国家机关一般工作人员出差伙食补助标准。
- 营养费：根据伤残情况参照医疗机构意见确定。
- 财产损失：包括车辆维修费、车上物品损失等，以实际损失为限，争议时可通过鉴定评估。
三、赔偿计算示例
假设摩托车总损失为20万元，其中交强险已赔付10万元（包括医疗费用、死亡伤残等），剩余10万元将按照责任比例分担。在摩托车次要责任的情况下，摩托车方自行承担30%（即3万元），对方承担70%（即7万元）。如果对方投保了商业第三者责任险，那么这7万元可由商业险在保险限额内赔付。
四、注意事项与争议解决
- 保留证据：事故认定书、维修发票、医疗费用清单等相关证据是理赔的重要依据，务必妥善保管。
- 及时通知保险公司：按照保险公司要求提交理赔材料，并积极协助定损工作。
- 争议解决途径：若理赔过程中产生争议，首先尝试友好协商；协商不成时，可通过交通管理部门调解或向人民法院提起诉讼来维护自身合法权益。
综上所述，摩托车在事故中承担次要责任时，赔偿的处理将遵循交强险优先赔付、超出部分按责任比例分担、商业险补充赔付以及个人承担剩余赔偿责任的原则。为确保合法权益得到保障，建议当事人充分了解相关法律法规及保险合同约定，并严格按照赔付流程进行操作。