结论前置：在员工病假期间，公司一般不能随意扣钱，而是需要依法支付病假工资或疾病救济费，具体支付标准需依据法律规定、公司规章制度及劳动合同来确定。
法律规定下的病假工资支付
法定医疗期内的工资支付：
- 根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》及相关通知，员工因病或非因工负伤需要停止工作治疗时，享有3至24个月的医疗期（具体时长根据工龄等因素确定）。
- 在此期间，公司需按不低于当地最低工资标准的80%支付病假工资或疾病救济费；部分地区或企业可能根据连续工龄的不同，规定更高的支付比例，如本人工资的60%至100%。
超出法定医疗期的处理：
- 若医疗期满后员工仍无法从事原工作或单位安排的其他工作，公司可依法解除劳动合同，但需提前30日书面通知并支付经济补偿金（每满一年支付一个月工资）。
- 解除合同时，公司可能还需发放不低于六个月工资的医疗补助费（针对重病或绝症情况）。
公司规章制度与劳动合同的影响
公司自主规定：
- 公司可能会根据自身的经营情况和员工管理需要，制定特定的病假政策，如设定特定的病假天数、请假流程及病假工资支付标准。
- 这些规定需在不违反法律法规强制性规定的前提下制定，并通常通过民主程序（如职工代表大会讨论）确定。
劳动合同约定：
- 劳动合同中也可能对病假期间的工资待遇进行明确约定，如约定病假工资为本人工资的某一比例或固定金额。
- 员工应仔细查阅劳动合同，了解自己在病假期间的权益和义务。
特殊情况下的工资扣除
未按规定提供病假证明：
- 若员工未及时提交医疗机构出具的病假证明或未按规定的流程请假，公司可能会根据规章制度进行处理，如视为旷工并扣发工资。
- 但公司的规章制度应当合理合法，不能违反法律关于病假工资的基本规定。
因劳动者过错导致停工治疗：
- 若因劳动者过错（如违反安全操作规程）导致停工治疗，停工期间可能不享受病假待遇，公司有权根据规章制度扣发工资。
员工权益保护与建议
保留凭证：
- 员工在病假期间应及时提交医疗机构出具的病假证明，并保留好相关凭证，以避免争议。
了解制度：
- 员工应熟悉公司关于病假审批流程、工资计算及支付标准的具体规定，以便在病假期间维护自己的权益。
协商沟通：
- 若对工资扣除有疑问或不满，员工应与公司的人力资源部门或工会进行协商沟通，寻求合理解决方案。
法律途径：
- 若公司违反法律规定或劳动合同约定，在员工病假期间不支付工资或支付的工资低于当地规定的标准，员工有权向劳动监察部门投诉或直接向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。
举例说明：假设某员工在公司工作满5年，因病需要停止工作治疗，享有6个月的医疗期。根据当地规定，病假工资不得低于最低工资标准的80%。若当地最低工资标准为2000元/月，则该员工在医疗期内每月至少应获得1600元的病假工资。若公司规章制度或劳动合同中规定了更高的支付比例（如本人工资的90%），则应按更高比例支付。
总结与建议：员工在病假期间应了解自己的权益和义务，并采取适当措施保护自身权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。