从旧兼从轻原则作为刑法适用中的核心原则，其核心在于保障法律的公正实施与被告人权益的保护，但该原则也存在一些例外情形。以下是对这些例外情形的详细分析：

1. 旧法已作出生效判决：

   • 处理原则：若案件在旧法时已经作出了生效判决，那么该判决将继续有效，不受新法影响。
   • 理由：这是为了维护法律的稳定性和判决的权威性。一旦判决生效，就应当得到尊重和执行，即使新法对此有不同的规定，也不能随意改变已生效的判决。
   • 举例：如某人在旧法期间因某罪被判处有期徒刑，新法施行后，即使新法对该罪的刑罚有所减轻，该人的刑罚也不会因此而改变。

2. 特定犯罪的追诉时效：

   • 处理原则：对于某些特定犯罪，如连续犯、继续犯等，如果其犯罪行为跨越了新旧法的实施时间，且在新法实施后仍在继续或追诉时效未过，那么可能需要根据新法的规定进行追诉，而不完全遵循从旧兼从轻原则。
   • 理由：这类犯罪的特殊性在于其犯罪行为的连续性或继续性，使得新旧法的适用变得复杂。为了维护社会秩序和公共利益，可能需要根据新法的规定进行追诉。
   • 举例：如某人长期从事非法集资活动，其犯罪行为跨越了新旧法的实施时间。在新法施行后，如果其犯罪行为仍在继续或追诉时效未过，那么可能需要根据新法的规定进行追诉。

3. 法律特别规定：

   • 处理原则：在某些特殊情况下，法律可能明确规定不适用从旧兼从轻原则，而是直接适用新法或旧法。
   • 理由：这通常是为了应对某些特定的社会问题或法律需求，如打击新兴犯罪、保护特定群体等。法律的特别规定具有优先性，应当得到遵守。
   • 举例：如针对某些新型网络犯罪，法律可能明确规定适用新法，而不考虑从旧兼从轻原则。

4. 国际条约或协定的适用：

   • 处理原则：在涉及国际条约或协定的案件中，如果国际条约或协定与国内法存在冲突，且国际条约或协定明确规定了适用规则（如优先适用新法），那么可能需要根据国际条约或协定的规定进行适用，而不完全遵循从旧兼从轻原则。
   • 理由：国际条约或协定是国际法的重要组成部分，具有优先于国内法的效力（在特定范围内）。为了维护国际关系的稳定和合作，需要遵守国际条约或协定的规定。
   • 举例：如我国与某国签订了引渡条约，约定对于特定犯罪的引渡适用新法。那么，在涉及该国引渡请求的案件中，就需要根据引渡条约的规定进行适用。

在处理具体案件时，需要综合考虑各种因素，包括案件的性质、犯罪行为的实施时间、新旧法的规定以及法律的特别规定等。作为专业律师，我会根据案件的具体情况，结合相关法律法规和司法实践，为当事人提供全面、准确的法律建议。如果你有任何法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。