公司薪资保密制度本身并不违法，但其具体实施方式和内容需符合法律法规的规定，不能侵犯员工的合法权益。以下是对这一问题的详细分析：
合法性基础
企业自主管理权：公司有权根据自身经营管理的需要，制定内部规章制度，包括薪资保密制度。这是企业自主管理权的一种体现，旨在维护公司内部的稳定和秩序，防止因薪资差异引发的内部矛盾。
法律法规未明确禁止：目前，我国的法律法规并未明确禁止公司实行薪资保密制度。因此，从法律层面来看，公司制定并实施薪资保密制度并不构成违法。
合法性限制
尽管薪资保密制度本身不违法，但其在实施过程中必须遵守以下限制条件，以确保不侵犯员工的合法权益：
不得违反同工同酬原则：薪资保密制度不能成为公司违反同工同酬原则的借口。公司必须确保相同岗位、相同工作内容的员工获得相同的报酬，不能因薪资保密而掩盖不合理的薪资差异。
不得侵犯员工知情权：员工有权了解自己的薪资构成和计算方式。薪资保密制度不能剥夺员工的这一基本权利。公司应在制定薪资保密制度时，明确告知员工其薪资的构成和计算方式，只是不公开具体数额或相对排名。
不得违反最低工资标准：公司制定的薪资保密制度必须确保员工的薪资不低于当地的最低工资标准。这是法律对员工基本生活保障的底线要求，任何内部规章制度都不能与之相抵触。
不得用于非法目的：薪资保密制度不能被公司用于非法目的，如掩盖贪污、挪用资金等违法行为。如果公司利用薪资保密制度进行非法活动，将构成违法，并可能承担相应的法律责任。
实施建议
明确制度内容：公司在制定薪资保密制度时，应明确制度的具体内容、实施方式和范围，确保员工清楚了解并遵守。
加强沟通解释：公司应加强与员工的沟通解释工作，让员工理解薪资保密制度的目的和意义，以及其对员工和公司的益处。
建立监督机制：公司应建立有效的监督机制，确保薪资保密制度的实施不侵犯员工的合法权益，并及时处理员工的投诉和举报。
定期审查更新：公司应定期审查薪资保密制度的实施情况，并根据实际情况进行更新和完善，以确保其始终符合法律法规的要求和公司的实际需要。
总结来说，公司薪资保密制度本身并不违法，但其在实施过程中必须遵守法律法规的规定，不得侵犯员工的合法权益。如果你对公司薪资保密制度的具体实施或合法性有疑问，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。