公司辞退员工时，经济补偿并非仅按基本工资计算，而是依据劳动者在本单位的工作年限及劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资来确定。以下是对这一问题的详细分析：

一、经济补偿的计算基数与方式

1. 工作年限与补偿月数：

   • 根据《中华人民共和国劳动合同法》，经济补偿按劳动者在本单位工作的年限来计算。具体为每满一年支付一个月工资的标准；六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，则向劳动者支付半个月工资的经济补偿。

2. 月工资的定义：

   • 这里的“月工资”指的是劳动者在劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资，它涵盖了基本工资、奖金、津贴、补贴以及加班加点工资等所有货币性收入。例如，若劳动者的基本工资为每月3000元，但加上其他收入后，过去十二个月的平均月收入为5000元，那么在计算辞退补偿时，应以这5000元作为月工资标准。

二、特殊情况下的补偿标准

1. 高薪员工的补偿限制：

   • 如果劳动者的月工资高于用人单位所在直辖市、设区的市级人民政府公布的本地区上年度职工月平均工资的三倍，那么向其支付经济补偿的标准将按职工月平均工资三倍的数额来支付，且支付年限最高不超过十二年。

2. 违法解除合同的赔偿：

   • 若用人单位违反规定解除或终止劳动合同，则需按照上述标准的二倍向劳动者支付赔偿金。

三、合法与不合法情况分析

1. 合法情况：

   • 若员工因严重违反公司规章制度、失职或被依法追究刑事责任等原因被辞退，且劳动合同或公司规章制度中有明确规定在此类情况下只支付基本工资（但需注意，这种规定通常较为罕见，且需不违反法律法规的强制性规定），则用人单位可能可以只发放基本工资。但即便如此，若员工能证明其实际工资构成中包含其他货币性收入，且这些收入是合理且合法的，员工仍有权要求用人单位按照实际工资构成支付经济补偿。
   • 在大多数情况下，如经济裁员或业务调整等非员工过错导致的辞退，用人单位需要按照员工实际的工资构成和应得收入支付工资及经济补偿。

2. 不合法情况：

   • 若用人单位没有合法的事实依据和法律依据随意辞退员工，属于违法解除劳动合同，不仅需要按照正常工资标准支付工资，还需按经济补偿标准的二倍向劳动者支付赔偿金。
   • 在劳动合同没有特别约定，且辞退原因不属于员工过错导致的情况下，用人单位未按照员工实际的工资构成和应得收入支付工资，只发放基本工资，是不合法的。

四、实践建议

• 对于员工而言：

  • 若对公司的辞退决定或补偿方案有异议，应及时收集相关证据，如工资条、劳动合同、辞退通知等，并向我咨询或向当地劳动监察部门投诉，确保自己的权益得到维护。
  • 在维权过程中，应确保诉求合理合法，并准备好相关证据材料以支持自己的主张。

• 对于用人单位而言：

  • 应严格遵守法律法规和劳动合同的规定，合理合法地处理员工的辞退和补偿事宜，避免引发不必要的法律纠纷。
  • 在辞退员工时，应确保经济补偿的计算准确无误，并按照规定支付给员工。

综上所述，公司辞退员工的经济补偿计算是一个综合考量工作年限、月工资水平以及特殊情况的复杂过程。在实际操作中，应严格按照相关法律法规执行，确保劳动者的合法权益得到保障。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。