结论前置：主合同签一年，附加协议签三年的情况，并不直接决定其合法性，关键在于合同及附加协议的具体内容是否合法，以及两者之间的关系是否符合法律规定。

分析说明：

1. 合同与附加协议的关系：

   • 在法律上，主合同与附加协议（或称为补充协议）应当具有一致性，附加协议通常是对主合同中未尽事宜或需要特别约定的内容进行补充或修改。
   • 如果附加协议的内容与主合同存在冲突，且该冲突无法通过解释或协商解决，那么可能会导致附加协议部分或全部无效。

2. 合同期限的约定：

   • 合同期限是合同的重要条款之一，它决定了合同双方权利义务的存续期间。
   • 主合同签一年，意味着合同的基本权利义务关系在一年内有效。而附加协议签三年，可能意味着对某些特定事项或权利义务的延长或特别约定。
   • 如果附加协议中的三年期限与主合同的一年期限在逻辑上能够自洽，且不违反法律法规的强制性规定，那么这样的约定是可能的。例如，附加协议可能约定了在主合同终止后，某些特定的后续义务或责任仍需继续履行三年。

3. 合法性的判断：

   • 要判断这样的合同及附加协议是否合法，需要具体查看合同及附加协议的内容，包括但不限于合同双方的主体资格、合同内容的合法性、合同形式的合法性以及合同是否违反法律法规的强制性规定等。
   • 如果合同及附加协议的内容均合法，且两者之间的关系符合法律规定，那么这样的合同及附加协议就是合法的。

法律建议：

• 在签订合同时，建议仔细审查合同及附加协议的内容，确保两者之间的逻辑关系清晰、内容合法，并避免出现冲突或歧义。
• 如果对合同及附加协议的合法性存在疑问，建议咨询专业律师进行审查，以确保自身权益得到保障。

总结：主合同签一年，附加协议签三年的情况并不直接决定其合法性，而需要具体查看合同及附加协议的内容以及两者之间的关系是否符合法律规定。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。