核心结论：针对甲方宅基地租给乙方允许翻建后又转让的情况，需分情形讨论乙方的权利及后续处理方式，主要涉及租赁合同效力、翻建合法性、转让对乙方的影响及救济途径等问题。以下是具体分析：

1. 租赁合同与翻建许可的效力

• 合同有效性：若甲方与乙方签订的宅基地租赁合同符合《民法典》第143条（行为人具有相应能力、意思表示真实、不违法违规），且租赁期限未超过20年（超过部分无效），则合同原则上有效。
• 翻建许可的合法性：乙方翻建需满足两个条件：
  • 行政审批：宅基地上建房需经乡镇政府审核批准，并取得乡村建设规划许可证（依据《土地管理法》第62条、《城乡规划法》第41条）。若乙方未获审批擅自翻建，可能构成违法建设，面临限期拆除、罚款等行政处罚。
  • 合同约定：若租赁合同明确约定乙方可翻建，且翻建行为符合合同目的（如长期使用），则乙方有权主张翻建的合法性；但若合同未约定或约定模糊，乙方可能需承担举证责任。

2. 甲方转让宅基地对乙方的影响

• “买卖不破租赁”原则的适用：根据《民法典》第725条，租赁物在承租人占有期间发生所有权变动的，不影响租赁合同效力。因此：
  • 若转让的是宅基地使用权：新所有权人（受让人）需继续履行原租赁合同，乙方有权按原合同约定使用宅基地及翻建后的房屋，直至合同期满。
  • 若转让的是宅基地上房屋所有权：因房屋与宅基地使用权不可分割，受让人同时取得宅基地使用权，但仍需受“买卖不破租赁”约束，乙方租赁权不受影响。
• 例外情形：若乙方翻建行为违法（如未获审批），或租赁合同本身无效（如违反“宅基地不得出租给非集体经济组织成员”的强制性规定），则乙方可能无法主张继续履行合同，需承担违法后果。

3. 乙方的救济途径

• 合同有效且翻建合法时：
  • 要求受让人继续履行合同：乙方可主张租赁合同对受让人具有约束力，要求其按原条款提供宅基地使用权。
  • 主张翻建成本补偿：若合同未约定翻建成本分担，乙方可依据《民法典》第510条（合同补充约定）或第511条（法定补充规则），要求受让人在合同终止时补偿翻建费用（需证明翻建价值及剩余使用年限）。
• 合同无效或翻建违法时：
  • 行政救济：若因未获审批被认定为违法建设，乙方需配合行政机关处理（如补办手续、接受处罚），否则可能面临强制拆除。
  • 民事索赔：若因甲方隐瞒宅基地权属瑕疵（如未告知已设定抵押、被查封）导致合同无效，乙方可依据《民法典》第157条要求甲方赔偿损失（包括翻建成本、预期利益等）。

4. 实务建议

• 核查宅基地权属与合同条款：乙方应要求甲方提供宅基地使用权证、规划许可文件，并明确租赁期限、翻建条件、转让限制等条款。
• 及时办理行政审批：翻建前务必向乡镇政府申请乡村建设规划许可证，避免因违法建设丧失权益。
• 合同中约定转让限制：可在租赁合同中增加“甲方转让宅基地需经乙方书面同意”或“转让后受让人需继续履行合同”等条款，增强权利保障。

总结：乙方能否继续使用宅基地及翻建房屋，需结合租赁合同效力、翻建合法性及转让性质综合判断。若合同有效且翻建合法，乙方权利受法律保护；若存在瑕疵，则需通过行政救济或民事索赔维护权益。建议乙方根据具体情况，携带合同、审批文件等材料进一步咨询，以便制定针对性方案。