药店擅自改变经营面积，可能面临行政处罚，具体处罚措施需结合改变面积的程度、是否影响经营资质以及当地监管要求综合判断。以下从不同角度展开分析：

1. 若改变经营面积导致不符合《药品经营许可证》登记条件

根据《药品管理法》第五十一条及《药品经营质量管理规范》（GSP）要求，药店的经营场所面积需与经营范围、规模相适应，并符合省级药品监管部门制定的具体标准（如零售药店面积一般不低于40平方米）。

• 处罚依据：若擅自缩小面积导致不符合登记条件，可能被认定为“未按照规定实施《药品经营质量管理规范》”，依据《药品管理法》第一百二十六条，由药品监管部门责令改正，给予警告；情节严重的，处十万元以上五十万元以下的罚款。
  
• 极端情况：若面积缩减导致无法满足基本经营条件（如无法分区存放药品、影响药品储存安全），可能被吊销《药品经营许可证》。

2. 若改变经营面积未影响资质但未备案或变更登记

根据《药品经营许可证管理办法》第十六条，药店变更经营场所面积等登记事项的，需在变更之日起30日内向原发证机关申请《药品经营许可证》变更登记。

• 处罚依据：未按规定变更登记的，依据《药品经营许可证管理办法》第三十二条，由药品监管部门警告并责令限期改正；逾期不改正的，可能面临五千元以上二万元以下的罚款。

3. 若改变经营面积涉及消防、规划等合规问题

药店经营场所需符合《消防法》及当地商业网点规划要求。若擅自扩大面积未通过消防验收或违反规划用途，可能面临：

• 消防处罚：依据《消防法》第五十八条，由消防救援机构责令停止施工、使用或停产停业，并处三万元以上三十万元以下罚款；
  
• 规划处罚：依据《城乡规划法》第六十四条，由城乡规划主管部门责令限期改正，处建设工程造价5%-10%的罚款。

4. 地方性法规的特殊要求

部分省份对药店面积有更严格规定（如广东省要求零售药店营业场所使用面积不少于40平方米，且仓库面积不少于20平方米）。若违反地方标准，可能依据地方性法规叠加处罚。

建议行动：

1. 立即核对当地药品监管、消防、规划部门的具体要求，评估面积变更是否合规；
   
2. 若需变更登记，尽快提交材料避免行政风险；
   
3. 若已受到处罚，可结合具体情节（如是否主动整改、是否造成危害后果）申请行政复议或诉讼。
   

如有进一步细节（如变更面积比例、是否收到整改通知等），可向我补充说明，我会为您分析具体应对方案。