违规捕鱼行为由多个部门共同处理，具体取决于违规行为的性质、情节以及造成的后果。以下是处理违规捕鱼行为的主要部门及其职责：

1. 农业农村部门（渔业渔政管理部门）：

   • 这是主管渔业生产、资源保护等全方位管理工作的部门。
   • 对于非法捕鱼行为，如使用禁用的渔具、捕捞方法或小于最小网目尺寸的网具进行捕捞等，农业农村部门有权进行调查、处罚，包括罚款、没收渔获物和违法所得、暂扣或吊销捕捞许可证等行政处罚。

2. 公安机关：

   • 当非法捕鱼行为涉嫌犯罪时，如达到一定的非法捕捞数量、在禁渔区或禁渔期使用严重破坏渔业资源的方法进行捕捞等，公安机关将负责立案侦查，并依法追究犯罪嫌疑人的刑事责任。
   • 对于可能危及公共安全的非法电鱼行为，公安机关也可依据以危险方法危害公共安全罪进行侦查和追诉。

3. 生态环境部门：

   • 如果非法捕鱼行为同时导致水域生态环境严重污染和破坏，如使用电鱼、毒鱼、炸鱼等极端方式捕鱼，生态环境部门将参与管理，并依据环境保护相关法律法规对涉事方进行查处。

4. 海事部门（如涉及出海捕鱼）：

   • 对于出海捕鱼涉及的海事问题，如船舶安全、船员资质等，海事部门也有权进行管理。

综上所述，违规捕鱼行为可能由农业农村部门、公安机关、生态环境部门及海事部门等多个部门共同处理。具体由哪个部门处理，需要根据违规行为的性质、情节以及造成的后果来综合判断。如果您遇到相关问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。