协商认定书一般是双方共同签署的，但在特定情况下也可能由单方出具并经对方认可。以下是对这一问题的详细分析：

双方共同签署的情况

在大多数情况下，协商认定书是双方就某一事项或纠纷进行协商后，共同达成一致意见并签署的书面文件。这种认定书具有双方合意的特点，体现了双方对协商结果的共同认可和接受。例如，在合同纠纷中，双方可能就合同履行中的问题、违约责任等事项进行协商，并达成一致意见后签署协商认定书，以明确双方的权利和义务。

单方出具并经对方认可的情况

虽然协商认定书通常由双方共同签署，但在某些特定情况下，也可能由一方出具并经对方认可。这种情况通常发生在以下情形中：

1. 一方主导协商过程：在协商过程中，一方可能处于主导地位，负责起草协商认定书的内容。然而，这并不意味着认定书可以单方面生效。为了确保认定书的合法性和有效性，起草方需要将其提交给对方进行审查和认可。只有对方同意并签署（或以其他方式表示认可，如盖章、按手印等），认定书才能生效。
2. 紧急情况或特殊需要：在某些紧急情况下或出于特殊需要，一方可能先行出具协商认定书，并尽快与对方取得联系以获取其认可。例如，在涉及紧急救援、事故处理等场合，为了及时明确责任、采取措施，一方可能先行出具认定书，并随后与对方进行协商和确认。

法律建议

1. 明确签署方式：在协商过程中，双方应明确协商认定书的签署方式。如果双方同意共同签署，则应在认定书上明确标注双方签署的位置和日期；如果由一方出具并经对方认可，则应在认定书上注明这一情况，并附上对方的认可证明（如签署、盖章、按手印等）。
2. 确保内容合法有效：无论协商认定书由双方共同签署还是由单方出具并经对方认可，都应确保其内容合法、有效。认定书应明确双方的权利和义务、协商结果的具体内容以及违约责任等事项，以避免后续纠纷的发生。
3. 保留相关证据：在协商和签署过程中，双方应保留好相关证据，如协商记录、往来邮件、短信等。这些证据可以在后续纠纷中作为证明协商过程和认定书合法性的重要依据。

如果您在协商认定书的签署过程中遇到任何问题或纠纷，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律建议。