在交通事故中，即使当事人负主要责任并导致一人死亡，检察院也有可能根据具体情况作出不起诉决定。这主要取决于事故的具体情节、当事人的行为性质、社会危害程度以及是否存在从轻或减轻处罚的情节等多个因素。以下是对此问题的详细分析：
一、法定不起诉情形
情节显著轻微、危害不大：
- 若死亡结果主要是由于死者自身存在重大过错，如突然闯入机动车道、未遵守交通信号等，且肇事者在事故发生后采取了积极有效的救助措施，如立即停车、报警、救助伤者等，其行为对危害结果的原因力相对较小，可能会被认为情节显著轻微，不构成犯罪，检察院可依法作出不起诉决定。
犯罪已过追诉时效期限：
- 交通肇事罪的追诉时效根据法定最高刑的不同而有所差异。若犯罪行为已超过相应的追诉时效期限，检察院应当作出不起诉决定。不过，在交通事故导致人员死亡的情况下，追诉时效通常较长，这种情况较为少见。
其他法定免责情形：
- 包括经特赦令免除刑罚（极为罕见）、犯罪嫌疑人或被告人死亡等情形，检察院亦会作出不起诉决定。
二、酌定不起诉情形
积极赔偿并获得谅解：
- 肇事者若能积极主动对死者家属进行足额赔偿，并取得其谅解，这反映了肇事者的悔罪态度及降低了社会危害性。检察院可能因此认为犯罪情节轻微，作出酌定不起诉决定。例如，肇事者与死者家属达成和解协议，并按照协议支付了赔偿金，取得了死者家属的书面谅解书。
自首、立功情节：
- 肇事者在事故发生后主动投案自首，如实供述罪行，或存在立功表现（如协助抓捕其他犯罪嫌疑人），根据法律规定，可从轻或减轻处罚，情节较轻的可免除处罚。检察院可能据此作出不起诉决定。例如，肇事者在事故发生后立即报警，并留在现场等待交警处理，同时在后续调查中积极配合，提供了有价值的线索，协助警方破获了其他案件。
认罪认罚：
- 肇事者自愿如实供述罪行，承认指控的犯罪事实，并愿意接受处罚，依据认罪认罚从宽制度，检察院可作出酌定不起诉决定。这要求肇事者对事故责任有清晰的认识，并表现出真诚的悔罪态度。
三、证据不足不起诉
- 若现有证据无法充分证明肇事者负事故主要责任，或无法确定死亡结果与肇事者行为之间存在直接因果关系，检察院会因证据不足而作出不起诉决定。此时，案件需经过二次补充侦查，若仍认为证据不足，则不符合起诉条件。例如，事故现场的监控视频模糊不清，无法清晰显示事故发生的全过程，或者目击证人的证言存在矛盾，无法形成完整的证据链。
四、法律后果与注意事项
法律后果：
- 即使检察院作出不起诉决定，当事人仍可能需承担民事赔偿责任或其他形式的法律后果。例如，肇事者可能需要赔偿死者家属的医疗费、丧葬费、死亡赔偿金等各项合理费用。
注意事项：
- 谅解书的作用：虽然取得被害人家属的谅解是积极因素，但并非决定性。检察院会全面考量案情后决定是否起诉，包括事故责任划分、肇事者的行为性质、社会危害程度等多个因素。
- 民事赔偿责任：即便检察院决定不起诉，肇事者仍需承担民事赔偿责任。这是基于民事侵权法律关系的存在，与刑事责任是否追究无关。
- 驾驶证处理：根据《道路交通安全法》，发生重大交通事故构成犯罪的，公安机关交通管理部门将吊销机动车驾驶证，且在一定期限内（如二年）不得重新申请。这是对肇事者的一种行政处罚措施。
总结与建议：在交通事故中负主要责任导致一人死亡的情况下，检察院是否起诉需综合考量多种因素。肇事者应积极配合调查，真诚悔罪，积极赔偿并取得谅解，同时寻求专业律师的帮助以争取最佳的法律结果。如果你或你身边的人遇到了类似的情况，可以直接向我咨询，我会根据具体情况提供详细的法律建议。