工厂在一般情况下并不会直接查询员工的案底，因为工厂作为普通用人单位，并不具备直接查询员工犯罪记录的权限。不过，我们可以从以下几个角度来详细分析这个问题：
一、工厂查询案底的权限与实际情况
权限限制：
- 根据相关法律法规，查询个人犯罪记录的权限主要归属于公安机关、国家安全机关、人民检察院和司法行政机关。工厂并非执法机构，因此不具备直接访问官方司法系统以获取员工案底信息的权限。
实际查询情况：
- 背景调查：对于某些大型企业或涉及特殊行业（如国家安全、金融安全、食品药品安全、教育等）的工厂，在招聘过程中可能会委托专业背景调查机构进行更为详尽的调查。但即便如此，这些机构也必须在合法合规的前提下进行查询，且查询范围通常受到严格限制。
- 主动申报：工厂通常会要求求职者在入职表格中如实填写是否有犯罪记录。若求职者选择隐瞒而后续被发现，其案底信息可能会因此暴露。
- 公权力介入：在特定情况下，如因工作相关事宜或其他原因，执法机关可能需要介入工厂进行调查，此时可能会向工厂披露相关人员的案底信息。
二、案底信息的隐私保护与特殊规定
隐私保护：
- 案底信息属于个人隐私范畴，受到法律的严格保护。任何单位和个人在未经授权的情况下，均不得随意查询、泄露或传播他人的案底信息。违反者将可能承担法律责任。
特殊规定：
- 对于曾经犯罪但不满十八周岁且被判处五年有期徒刑以下刑罚的人员，其犯罪记录应当被封存。除非司法机关为办案需要或有关单位根据国家规定进行查询，否则这些记录不得被提供或泄露。这一规定旨在保护未成年人的合法权益，促进其改过自新和社会融入。
三、工厂背景调查的深度与对求职者的影响
调查深度：
- 工厂在进行背景调查时，通常会采用多种方式，包括电话访谈、邮件询问、实地走访等。对于关键岗位或涉及敏感信息的职位，工厂可能会进行更为深入的调查。然而，由于案底信息的隐私保护原则，即使进行深入调查，工厂也不一定能够查询到所有的案底信息。
对求职者的影响：
- 如果工厂进行了深入的背景调查，并且求职者的案底不属于被封存的情况，那么其案底信息可能会被查出。这可能会对求职者的录用机会产生一定影响。但值得注意的是，有案底的人仍然享有劳动的权利和义务，他们有权参与工作并获取报酬。工厂在招聘过程中应综合考虑求职者的整体素质和能力，而非仅仅依据其是否有案底来做出决定。
四、求职者的权益保护与法律途径
- 求职者在求职过程中应了解自己的权益和义务，保护好自己的个人隐私。如果认为自己的隐私受到了侵犯，可以通过法律途径来维护自己的合法权益。例如，可以向相关部门投诉举报，或者寻求法律援助以提起诉讼。
总结与建议：
工厂在招聘过程中无法直接查询员工的案底信息，而是依赖于员工的诚信申报、特定情形下的背景调查以及公权力的介入。同时，案底信息受到法律的严格保护，任何未经授权的查询和泄露都是违法的。因此，求职者无需过分担心工厂会直接查询其案底信息，但应如实填写入职表格中的相关内容，以避免后续可能出现的法律风险。如果求职者对自己的案底信息有疑虑或担忧，可以咨询专业律师以获取更具体的法律建议。