关于药店或养生馆等场所进行针灸按摩是否合法的问题，这主要取决于该场所是否具备相应的医疗资质和执业许可。

首先，我们需要明确的是，针灸作为一种具有创伤性、侵入性的医疗技术，其操作需要严格的医疗环境和专业的医疗人员。根据国家中医药管理局办公室和国家卫生和计划生育委员会办公厅发布的《关于打击非法行医专项行动中有关中医监督问题的批复》，非医疗机构及其人员在经营活动中是不得使用针刺、瘢痕灸、发泡灸等具有创伤性、侵入性或者高危险性的技术方法的。这意味着，如果药店或养生馆等场所未取得《医疗机构执业许可证》，就擅自开展针灸等诊疗活动，那么这种行为是违法的。

其次，对于按摩等非侵入性的保健服务，虽然其风险相对较低，但也需要确保操作人员具备相应的专业知识和技能，并且场所需要符合相关的卫生和安全标准。然而，这并不意味着任何场所都可以随意提供按摩服务。如果按摩服务涉及到对疾病的诊断和治疗，或者使用了具有医疗性质的技术和方法，那么该场所同样需要取得相应的医疗资质和执业许可。

以您提供的案例为例，某养生馆未取得《医疗机构执业许可证》，就擅自开展针灸等诊疗活动，结果被卫生执法部门查处并受到了行政处罚。这个案例充分说明了非医疗机构擅自开展医疗活动的违法性和风险性。

因此，我建议您在选择药店或养生馆等场所进行针灸按摩等服务时，一定要先确认该场所是否具备相应的医疗资质和执业许可。如果无法确认或者存在疑虑，最好选择正规的医疗机构进行咨询和治疗。同时，如果您发现任何非法行医的行为，也可以及时向当地的卫生执法部门进行举报，以维护自己和他人的健康权益。