双方车库交换是否违法需分情况讨论，核心结论如下：

1. 若车库产权清晰且交换行为符合物权登记及税务规定，则不违法
   根据《民法典》第209条，不动产物权的设立、变更、转让和消灭需依法登记才发生效力。若双方车库均有合法产权证，且交换后及时办理产权过户登记（如到不动产登记中心变更权属人），同时依法缴纳契税、个人所得税等税费（具体税率以当地政策为准），则交换行为合法有效。
   操作建议：签订书面《车库交换协议》，明确约定交换标的、价款（如有差价需注明）、过户时间、违约责任等条款，并留存产权证、身份证明等材料，确保程序合规。

2. 若车库存在产权瑕疵或未履行法定程序，则可能违法

   • 无产权证的车库：若车库属于人防工程、公共配套设施或未取得规划许可的违建，根据《城乡规划法》第64条，此类车库不得擅自转让，交换行为可能被认定为无效，甚至面临行政处罚（如限期拆除、罚款）。
     
   • 未办理过户登记：即使双方签订协议，若未完成产权变更登记，根据《民法典》第215条，物权未实际转移，原产权人仍可主张权利，买方可能面临“钱房两空”风险。
     
   • 逃避税费：若通过“阴阳合同”低价申报或未申报税费，根据《税收征收管理法》第63条，可能被追缴税款、滞纳金，并处不缴或少缴税款50%至5倍的罚款；情节严重者可能构成逃税罪（《刑法》第201条）。
     

3. 若车库交换涉及共有财产，需全体共有人同意
   若车库为夫妻共同财产或与其他人共有，根据《民法典》第301条，处分共有不动产需经全体共有人书面同意。若一方未经同意擅自交换，共有人可主张合同无效或要求赔偿损失。

风险提示与应对：

• 交换前务必核查车库产权证、规划许可等文件，确认无抵押、查封等权利限制；
  
• 涉及差价时，建议通过银行转账并备注“车库交换差价”，保留资金往来凭证；
  
• 若对车库性质或程序存疑，可携带相关材料向当地不动产登记中心、税务局或规划部门咨询，确保合法合规。
  

如有具体案例或细节需要进一步分析，可直接向我说明，我会结合实际情况提供更精准的建议。