关于公司按最低工资标准缴纳公积金是否合法的问题，这主要取决于员工的实际工资水平与当地规定的最低缴存基数之间的关系，以及公司是否遵循了相关法律法规。

首先，我们需要明确法律依据：

根据《住房公积金管理条例》的相关规定，职工住房公积金的月缴存基数应为职工本人上一年度月平均工资。对于新调入的职工，月缴存基数则为职工本人当月工资。这意味着，公积金的缴存基数应当紧密反映职工的实际工资收入，而非简单地以最低工资标准为基准。

接下来，我们分析合法与不合法的情形：

1. 合法情形：

   • 当员工的月工资收入低于或等于当地规定的住房公积金最低缴存基数时，公司按照该最低标准为其缴存住房公积金是符合法律规定的。例如，若当地最低缴存基数为2000元，而某员工月工资为1800元，公司按2000元为基数缴纳即为合法。但这种情况较为特殊，因为通常员工的实际工资会高于最低工资标准。

2. 不合法情形：

   • 如果员工的实际工资高于当地规定的最低缴存基数，但公司却统一按最低标准缴纳，这明显违反了《住房公积金管理条例》的规定。例如，员工上一年度月平均工资为8000元，而公司却按当地最低缴存基数2000元来缴纳，这种做法是不合法的。

此外，我们还需要关注缴存比例：

《住房公积金管理条例》还明确规定，职工和单位住房公积金的缴存比例均不得低于职工上一年度月平均工资的5%。有条件的城市可以适当提高缴存比例，但具体比例需由住房公积金管理委员会拟订，并经过本级人民政府审核及上级人民政府批准。因此，即使公司按最低缴存基数缴纳，如果缴存比例也低于法定标准，同样是不合法的。

员工权益与公司责任：

住房公积金是员工的重要福利，对于解决住房问题、提高生活质量具有重要意义。公司应严格按照员工实际工资水平合理确定缴存基数和缴存比例，以充分保障员工的权益。即使按最低标准缴纳在法律上可能合法（仅当员工工资低于或等于最低缴存基数时），公司也应考虑员工的实际需求和利益，尽可能提高缴存水平，以增强员工归属感和忠诚度，同时提升公司整体形象和竞争力。

法律救济途径：

若劳动者认为公司缴纳的公积金不符合规定，首先应与公司沟通协商，要求调整缴存基数和缴存比例。协商不成时，可向当地住房公积金管理中心投诉举报，由管理中心责令公司限期改正；逾期不改的，可对公司处以1万元以上5万元以下的罚款。

总结与建议：

综上所述，公司按最低工资标准缴纳公积金在多数情况下是不合法的，除非员工的实际工资确实低于或等于当地规定的最低缴存基数。公司应严格遵守相关法律法规，按照职工的实际月平均工资作为缴存基数，并确保缴存比例符合规定。同时，建议职工密切关注自己的公积金缴存情况，如发现公司存在违法行为，应及时向相关部门投诉并寻求法律帮助。