您好，关于机动车非法营运的处理，这是一个涉及法律法规的严肃问题，我会为您详细解答。
首先，我们需要明确什么是非法营运。非法营运指的是未依法取得营运权而擅自从事道路运输经营的行为，这包括未取得道路运输经营许可、使用无效证件或超越许可事项进行经营等情形。此类行为严重扰乱了市场秩序，损害了合法经营者的权益，同时也可能给乘客带来安全隐患。
对于非法营运的处理，主要分为行政处罚和刑事处罚两大类：
一、行政处罚
调查取证与扣押车辆：交通运输管理部门有权对涉嫌非法营运的车辆进行调查，通过现场检查、询问乘客和司机、收集证据等方式确定违法行为。一旦有初步证据证明非法营运，管理部门可以依法扣押涉案车辆，以防止违法行为继续，并保障后续处理程序的顺利进行。
罚款与没收违法所得：根据《中华人民共和国道路运输条例》，对非法营运行为可处以罚款。具体罚款金额依据当地法规及非法营运情节的严重程度来确定，通常在数千元到数万元不等。对于有违法所得的，还会没收违法所得，并处违法所得2倍以上10倍以下的罚款；没有违法所得或违法所得不足2万元的，处3万元以上10万元以下的罚款。
其他行政处罚：对于未经许可擅自从事道路旅客运输站（场）经营、机动车维修经营等违法行为，管理部门也有权采取责令改正、罚款、没收违法所得以及责令停业整顿等处罚措施。
二、刑事处罚
如果非法营运行为严重扰乱市场秩序，情节特别严重，那么可能构成非法经营罪。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，对于构成非法经营罪的非法营运行为，可处五年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处违法所得一倍以上五倍以下罚金；情节特别严重的，处五年以上有期徒刑，并处违法所得一倍以上五倍以下罚金或者没收财产。
三、车辆所有人的应对措施
如果您的车辆被认定为非法营运，您需要在规定时间内前往指定交通执法部门接受处理，并携带身份证、车辆行驶证等相关证件。在接受处理过程中，您有权进行陈述和申辩，向执法部门说明情况。如果对处罚决定无异议，您应按要求在规定期限内缴纳罚款及可能产生的其他费用（如车辆保管费，但有些地方对于合理期限内的保管不收费）。完成所有处理程序并缴纳相关费用后，您可以按交通执法部门要求办理车辆取回手续，领回被扣押的车辆。
四、特殊情况的处理
租赁车辆：如果非法营运车辆为租赁而来，租车公司可能需要配合调查。在不知情的前提下出租给非法营运者，租车公司通常不需承担主要责任，但需协助执法部门提供相关资料。
涉及交通事故：非法营运车辆在营运过程中发生交通事故，处理更为复杂。首先按交通事故处理程序由交警部门认定事故责任，同时非法营运行为仍会按规定处理。在事故赔偿方面，非法营运不影响责任划分和赔偿责任承担，但可能影响保险理赔。
五、建议与总结
非法营运行为将面临严厉的法律制裁，包括行政处罚、刑事处罚以及其他相关处理措施。因此，我强烈建议您和所有驾驶员严格遵守相关法律法规，远离非法营运活动。合法合规经营不仅是对自己负责，也是对乘客和社会负责。
希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。