当夫妻一方发现小孩不是亲生时，这确实是一个复杂且敏感的问题，需要从法律、情感和实际操作等多个层面来综合考虑和处理。以下是我为您提供的详细解答：

一、法律层面的处理

1. 婚姻关系及损害赔偿

   • 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，若一方隐瞒孩子非亲生的事实，这构成对另一方的欺诈，严重损害了对方的精神和财产利益。因此，无过错方在离婚时，有权要求过错方赔偿因抚养非亲生子女而产生的费用，以及相应的精神损害抚慰金。
   • 无过错方需要收集证据，如亲子鉴定报告、配偶的不正当关系证据等，以证明配偶存在隐瞒孩子非亲生的事实，作为主张损害赔偿的依据。

2. 亲子关系否认之诉

   • 若对亲子关系有异议，且有正当理由，父或母可以向人民法院提起诉讼，请求确认或者否认亲子关系。法院将依据双方提供的证据进行审理，并作出相应判决。
   • 一旦亲子关系被否认，法律意义上的亲子关系即告解除。若一方已提供必要证据证明亲子关系不存在，而另一方拒绝做亲子鉴定，法院可认定否认亲子关系一方的主张成立。

3. 抚养费的返还

   • 非亲生子女的抚养方在不知情的情况下支出的抚养费，构成不当得利。因此，抚养方有权要求返还已支付的抚养费。
   • 法院在审理时，会综合考虑抚养的实际情况、孩子的年龄、支出的合理性等因素，确定应返还的抚养费数额。

二、情感层面的处理

• 发现孩子非亲生无疑会对夫妻关系造成巨大冲击。此时，双方需要冷静沟通，尽量理性地处理问题，避免情绪化的冲突。
• 考虑到孩子的感受，无论最终处理结果如何，都应尽量减少对孩子的伤害，保护他们的心理健康。

三、实际操作层面的建议

1. 及时咨询专业律师

   • 在处理此类问题时，法律专业知识的支持至关重要。因此，建议受害方及时咨询专业律师，获取合适的法律建议。

2. 收集并保存证据

   • 包括亲子鉴定报告、配偶的不正当关系证据、抚养费支出凭证等，这些证据将在后续的法律诉讼中起到关键作用。

3. 考虑孩子的抚养和探视问题

   • 若决定变更抚养关系，应与对方协商孩子的抚养和探视问题，确保孩子的健康成长。若协商不成，可由法院判决。

4. 关注自身心理健康

   • 此类事件可能对受害方的心理健康造成严重影响。因此，建议受害方在处理问题的同时，关注自己的心理健康，必要时可寻求心理咨询师的帮助。

综上所述，当夫妻一方发现小孩不是亲生时，应从法律、情感和实际操作等多个层面来综合考虑和处理。通过及时咨询专业律师、收集并保存证据、考虑孩子的抚养和探视问题以及关注自身心理健康等措施，可以更有效地维护自己的合法权益并减少对孩子的伤害。