纳税人自查补正通知书的法律依据主要包括《中华人民共和国税收征收管理法》及其实施细则。具体分析如下：

1. 《中华人民共和国税收征收管理法》
   该法第五十六条规定：“纳税人、扣缴义务人必须接受税务机关依法进行的税务检查，如实反映情况，提供有关资料，不得拒绝、隐瞒。”
   税务机关在税收征管过程中，若发现纳税人存在涉税风险或疑点，可依据此条款要求纳税人开展自查，并通过补正通知书明确自查范围、期限及补正要求。

2. 《中华人民共和国税收征收管理法实施细则》
   实施细则第八十五条进一步细化：“税务机关应当建立科学的检查制度，统筹安排检查工作，严格控制对纳税人、扣缴义务人的检查次数。税务机关应当制定合理的税务稽查工作规程，负责选案、检查、审理、执行的人员应当相互分离、相互制约。”
   自查补正通知书可视为税务机关“统筹安排检查工作”的一种形式，通过引导纳税人主动纠正问题，既保障税收征管效率，又体现对纳税人合法权益的尊重。

3. 税务规范性文件的补充依据
   国家税务总局发布的《税务稽查案件办理程序规定》等文件明确，税务机关在检查过程中可采取“自查自纠”方式，要求纳税人限期补正申报、补缴税款或调整账务。此类文件虽效力层级低于法律，但属于具体操作依据，与上位法形成衔接。

实务建议：
若您收到自查补正通知书，需重点关注以下内容：

• 核实通知书引用的具体法律条款及税务机关提出的疑点；
  
• 结合自身业务情况，评估补正税款、滞纳金或罚款的合理性；
  
• 如对通知书内容有异议，可依法申请行政复议或提起行政诉讼。
  

如有进一步疑问，欢迎直接向我咨询，我将结合具体案情为您详细分析。