结论：已注册的商标如果发现字体侵权，是可以修改字体的，但修改过程中及修改后需注意一系列法律问题，以确保合规并避免新的法律风险。
详细分析：
立即停止使用侵权字体：
- 一旦发现商标字体侵权，首要步骤是立即停止在所有商业活动中使用该侵权字体，包括产品包装、广告宣传、网站页面等所有涉及商标的渠道。这是避免进一步法律责任和损害扩大的关键。
选择合法且独特的商标字体：
- 免费开源字体：如黑体、宋体、楷体等，这些字体通常无版权限制，可以自由使用。但需注意，某些免费字体可能要求在使用时注明来源或遵循特定使用条件。
- 付费商用字体：购买具有合法授权的商用字体，并从正规渠道获取授权。这可以确保字体的合法性，避免新的侵权风险。
- 定制设计字体：聘请专业字体设计师量身定制字体，确保字体的独特性和合法性。这种方式虽然成本较高，但可以完全避免字体侵权问题。
修改商标及相关物料：
- 根据选定的合法字体，对商标进行重新设计和修改。在修改过程中，应保持与原商标的连贯性和辨识度，以确保品牌形象的稳定性。
- 对所有涉及侵权字体的物料进行更新替换，包括产品包装、宣传海报、网站页面等。这可以确保品牌形象的一致性，并避免因使用侵权字体而引发的法律纠纷。
法律风险排查与监测：
- 在修改商标字体后，应对企业的其他知识产权使用情况进行全面排查，确保不存在其他潜在的侵权风险。
- 建立长期的知识产权监测机制，定期对市场上的商标使用情况进行监测。这可以及时发现并应对新的侵权问题，保护企业的合法权益。
关于版权登记的特别提醒：
- 版权保护的是文字的表现形式，即具有美感的字体设计，而商标权保护的是文字的音、形、意。因此，在他人商标权注册在先的情况下，事后做版权登记并不能形成不侵权抗辩。
- 如果商标字体具有创造性，且在享有商标权的前提下，可以考虑进行版权登记，以从另一个层面起到保护作用。但需注意，版权登记并不能替代商标权的保护，也不能作为侵权抗辩的依据。
可能遇到的法律后果及建议：
- 如果未及时停止使用侵权字体或未进行合法修改，可能面临商标侵权诉讼，需要承担停止侵权、赔偿损失等法律责任。
- 在修改商标字体时，应确保新字体不侵犯他人的知识产权，避免陷入新的法律纠纷。
- 如果对商标字体的合法性存在疑问或需要进一步的法律指导，可以直接向我咨询，我会根据具体情况提供专业的法律意见。
总结：已注册的商标如果发现字体侵权，应及时停止使用侵权字体，并选择合法且独特的商标字体进行修改。在修改过程中及修改后，需注意法律风险排查与监测，以确保合规并避免新的法律风险。如有任何疑问或需要进一步的法律指导，请直接向我咨询。