事实婚姻分开是否需要法院判决，主要取决于双方是否存在争议以及争议的具体内容。以下从不同角度为您详细分析：
一、无需法院判决的情况
双方无争议且能自行协商：
- 如果双方对事实婚姻的存在无争议，且能就分开后的相关事宜（如财产分割、子女抚养等）自行协商并达成一致意见，那么无需法院介入。双方可以依据协商结果，自行处理生活事务。
单纯确认事实婚姻关系：
- 若双方仅想确认彼此存在事实婚姻关系，而无其他争议，同样可以自行认定并据此处理生活事务，无需法院进行判决。
二、需要法院判决的情况
财产分割纠纷：
- 当事实婚姻双方因财产分割产生争议，无法协商一致时，任何一方均可向法院提起诉讼。法院将依据法律规定和公平原则，综合考虑双方的具体情况，对财产进行依法分割。例如，双方可能因共同购买的房产、车辆等财产的归属问题产生争议，这时就需要法院来作出公正判决。
子女抚养纠纷：
- 若事实婚姻双方就子女的抚养权归属、抚养费的数额和支付方式等问题产生争议，且无法通过协商解决，同样需要向法院提起诉讼。法院将从有利于子女身心健康、保障子女合法权益的角度出发，结合父母双方的抚养能力和条件，作出公正判决。比如，双方可能因工作原因、经济条件等因素，在子女的抚养权上产生分歧，这时就需要法院来裁决。
解除事实婚姻关系（特定情况下）：
- 对于1994年2月1日民政部《婚姻登记管理条例》公布实施以前已符合结婚实质要件的事实婚姻，若双方欲解除关系而无法自行达成协议，需向法院提起离婚诉讼，由法院判决是否准予离婚。这是因为在此之前，事实婚姻在法律上是被认可的，所以解除时也需要通过法律程序。
- 对于1994年2月1日以后符合结婚实质要件但未办理结婚登记的情况，按同居关系处理。若因同居期间的财产分割或子女抚养问题提起诉讼，法院将受理并对相关问题作出判决，但不会单纯就同居关系的解除作出判决。这是因为在此之后，法律不再承认新形成的事实婚姻的法律效力，所以解除时不需要通过法院判决同居关系的解除。
三、法律建议
- 在处理事实婚姻分开的问题时，建议双方首先尝试通过协商解决问题，以减少不必要的法律纠纷和成本。
- 如果双方存在争议且无法协商一致，建议及时咨询并寻求我的帮助。我可以根据具体情况提供个性化的法律建议，协助当事人更好地维护自身权益。
- 在诉讼过程中，双方应积极收集相关证据，以便有力地支持自己的主张。例如，可以收集共同生活的照片、视频、证人证言等证据来证明事实婚姻的存在；收集财产证明、收入证明等证据来支持自己的财产分割或子女抚养主张。
希望以上分析能对您有所帮助。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。