结论：通常情况下，征用土地的补偿应由行政部门负责支付，企业一般不应直接承担补偿费用。但在某些特定情况下，企业可能会因与土地相关的特定责任或协议而涉及补偿事宜。以下是对此问题的详细分析：
行政部门在征用土地中的角色与责任：
- 根据相关法律法规，行政部门在征用土地时，有责任对被征用的土地及其上的附着物、青苗等给予合理的补偿。这是行政部门的法定职责，旨在保障被征地农民的合法权益，确保土地征用的合法性和公正性。
- 补偿费用通常包括土地补偿费、安置补助费、地上附着物和青苗的补偿费等，这些费用应由行政部门从财政预算中安排，并按时足额支付给被征地农民或相关权利人。
企业可能涉及补偿的情况：
- 企业作为土地使用者：如果企业是通过合法方式取得土地使用权的，且在土地征用过程中因土地被征用而遭受损失，那么企业有权作为被征地单位或相关权利人获得相应的补偿。但这种情况下，补偿费用仍应由行政部门支付，而非企业自行承担。
- 企业与行政部门有特定协议：在某些特殊情况下，企业可能与行政部门签订了关于土地征用的特定协议，其中可能约定了企业需承担部分或全部补偿费用的条款。这种情况下，企业需按照协议约定履行补偿责任。但这种情况较为罕见，且需严格遵循法律法规和公平原则。
- 企业存在违法行为或责任：如果企业在土地使用过程中存在违法行为（如非法占用土地、破坏土地资源等），且这些行为与土地征用有关，那么企业可能需要承担相应的法律责任，包括赔偿因违法行为造成的损失。但这种情况下，企业的赔偿责任与土地征用的补偿费用是两个不同的概念，不应混淆。
法律建议：
- 如果您作为被征地农民或相关权利人，发现行政部门要求企业支付补偿费用，而您认为这不符合法律法规或协议约定，建议您及时向行政部门提出异议，并要求行政部门依法履行补偿责任。
- 如果您作为企业，被要求支付土地征用的补偿费用，且您认为这不符合法律法规或协议约定，建议您咨询专业律师，了解您的权利和义务，并依法维护自己的合法权益。
可能后果与进一步思考：
- 如果行政部门或企业违反法律法规或协议约定，未按时足额支付补偿费用，可能会引发法律纠纷和行政诉讼，对双方造成不必要的损失和麻烦。
- 因此，在处理土地征用补偿事宜时，建议各方严格遵守法律法规和协议约定，确保补偿费用的合法性和公正性。如有任何疑问或争议，应及时咨询专业律师或相关部门，以维护自己的合法权益。