结论：在刑事案件中，原告撤诉后是否会有案底，主要取决于案件的性质（公诉或自诉）、撤诉的具体原因以及法院的处理结果。在大多数情况下，撤诉后的案件记录不会对个人产生长期的负面影响，但具体情形仍需细致分析。
一、公诉案件中的撤诉与案底
被害人的权利与撤诉限制：
- 在公诉案件中，被害人并不享有撤诉的权利。是否对犯罪嫌疑人提起诉讼，由检察院根据证据和法律规定来决定。
不起诉与案底：
- 侦查阶段撤销案件：若侦查中发现犯罪嫌疑人不应被追究刑事责任（如行为情节显著轻微、危害不大，或犯罪已过追诉时效等），案件将被撤销。在此情况下，犯罪嫌疑人不会留下案底。
- 审查起诉阶段不起诉：包括法定不起诉（如无犯罪事实或符合《刑事诉讼法》第十六条规定的情形）、酌定不起诉（犯罪情节轻微，不需判处刑罚或免除刑罚）和证据不足不起诉（二次补充侦查后仍认为证据不足）。在这些情况下，被不起诉人均不会受到刑事审判，因此不会产生案底。但需注意，酌定不起诉的决定书可能会存入个人档案，作为一种特殊记录。
有罪判决与案底：
- 若检察院提起公诉且法院判决有罪，即使被害人表示谅解，犯罪行为人也会因有罪判决而留下案底。
二、自诉案件中的撤诉与案底
自诉人的权利与撤诉：
- 自诉案件包括告诉才处理的案件和被害人有证据证明的轻微刑事案件等。自诉人有权撤诉，包括因缺乏罪证且未补充证据而撤诉，以及自行和解或撤回自诉。
撤诉后的影响：
- 若自诉人撤诉且法院未作有罪判决，行为人不会留下案底。撤诉意味着诉讼程序的终止，但相关司法记录和档案仍会在司法机关留存一段时间，这些记录不构成正式的犯罪记录，也不会对个人产生长期的负面影响。
三、案底的理解与影响
案底的定义：
- “案底”通常指的是一个人在司法机关的犯罪记录或涉案记录，可能对个人未来的生活、工作产生影响。
撤诉后的案底问题：
- 撤诉后，虽然诉讼程序终止，但相关司法记录和档案仍会留存。这些记录不等同于正式的犯罪记录，其影响相对有限。在大多数情况下，撤诉后的案件记录不会对个人造成实质性的不利影响。然而，若涉及特定情况（如国家安全、严重犯罪等），这些记录可能会被相关机构查询和使用。
四、特殊情况说明
- 诉讼过程中的其他行为：虽然撤诉本身不会给被告留下案底，但如果在诉讼过程中，被告存在其他违法或违规行为（如妨碍诉讼秩序），这些行为可能会被单独处理并记录在案。然而，这些记录与案底有本质区别，它们并不等同于因犯罪行为而产生的案底。
- 行政处罚记录：即使案件撤案没有犯罪记录，但在案件办理过程中，若发现有相关的行政违法行为并给予了行政处罚（如罚款、行政拘留等），则会留下行政处罚的记录。这种记录虽不同于犯罪案底，但也属于一种不良记录，可能对个人的未来产生一定影响。
建议：为了维护个人的法律权益和声誉，当事人在涉及刑事案件时，应及时了解案件进展，并在必要时咨询专业律师。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。