结论：政府入户调查村民侵占历史道路的行为是否违法，需根据具体情况判断，包括政府行为的合法性、程序正当性以及村民侵占行为的性质等。以下从多个角度进行分析：
一、政府行为的合法性
法律依据：
- 政府对土地和道路的管理通常依据《中华人民共和国土地管理法》、《中华人民共和国公路法》等相关法律法规。这些法律赋予了政府对土地和道路进行规划、管理、保护等职责。
入户调查的合法性：
- 如果政府是为了履行其管理职责，对涉嫌侵占历史道路的行为进行调查，且调查行为符合法定程序，如持有合法的调查令、出示相关证件等，那么这种入户调查行为通常是合法的。
二、程序正当性
调查程序：
- 政府在进行入户调查时，应当遵循正当程序，包括事先通知、出示证件、说明调查目的和依据等。如果政府未遵循这些程序，可能会构成程序违法。
村民权利保障：
- 村民在面对政府调查时，有权要求政府出示合法证件、说明调查目的和依据，并有权拒绝非法调查。如果政府行为侵犯了村民的合法权益，村民可以通过法律途径维护自己的权益。
三、村民侵占行为的性质
侵占行为的认定：
- 村民侵占历史道路的行为，如果未经合法批准，且影响了道路的正常使用或公共利益，那么这种行为可能构成违法侵占。
法律后果：
- 对于违法侵占行为，政府有权要求村民停止侵占、恢复原状，并可能根据情节轻重处以罚款等行政处罚。如果村民拒不执行，政府还可以申请人民法院强制执行。
四、特殊情况考虑
历史遗留问题：
- 如果历史道路的形成存在特殊的历史背景或遗留问题，政府在处理时可能需要考虑更多的因素，如村民的实际使用情况、道路的历史价值等。
政府行为的目的：
- 政府入户调查的目的应当是为了维护公共利益和法律秩序，而非滥用职权或侵犯村民权益。如果政府行为的目的不正当，那么即使程序合法，也可能构成违法。
五、建议与行动
对于村民：
- 如果村民认为政府的入户调查行为违法或侵犯了自己的权益，可以要求政府出示合法证件和调查依据，并有权向相关部门投诉或寻求法律援助。
对于政府：
- 政府在进行入户调查时，应当严格遵守法律法规和正当程序，确保调查行为的合法性和正当性。同时，政府也应当积极与村民沟通，解释调查目的和依据，争取村民的理解和支持。
总结：政府入户调查村民侵占历史道路的行为是否违法，需根据具体情况判断。如果政府行为合法、程序正当，且村民确实存在违法侵占行为，那么政府的行为是合法的。反之，如果政府行为违法或侵犯了村民的合法权益，村民有权通过法律途径维护自己的权益。如果您有具体的法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。