结论：即便您公司的营业执照已经注销，您仍然有权继续起诉对方公司追讨欠款，但需要注意诉讼主体资格的变更以及相关证据的收集和保存。
分析说明：
诉讼主体资格：
- 公司注销后，其法人资格即告终止，不再具有诉讼主体资格。但这并不意味着原公司的债权就此消灭。
- 在实际操作中，通常由原公司的股东或清算组作为权利义务的承继者来参与诉讼。因此，您需要确定是由哪个主体（如股东、清算组）来继续这场诉讼。
债权债务关系：
- 对方公司欠您公司的钱，这是一笔明确的债权债务关系。只要这笔债务在注销前已经存在，并且没有因为注销而得到清偿或豁免，那么您就有权继续追讨。
- 您需要收集并保存好所有与这笔债务相关的证据，如合同、发票、对账单、付款记录等，以证明对方公司确实欠您公司钱。
诉讼程序：
- 在确定了诉讼主体资格和收集好相关证据后，您可以向法院提起诉讼，要求对方公司偿还欠款。
- 诉讼过程中，您需要遵循法院的诉讼程序，如提交诉状、参加庭审、提供证据等。
可能面临的挑战：
- 对方公司可能会提出各种抗辩理由，如债务已经清偿、债务不存在、诉讼时效已过等。您需要针对这些抗辩理由准备充分的反驳证据。
- 如果对方公司已经破产或资不抵债，那么即使您赢得了诉讼，也可能面临执行难的问题。在这种情况下，您可能需要考虑申请对方公司破产清算或参与破产分配等程序。
行动建议：
- 确定诉讼主体：尽快确定由哪个主体（如股东、清算组）来继续这场诉讼，并办理好相关的手续和授权。
- 收集证据：全面收集并保存好所有与这笔债务相关的证据，确保在诉讼过程中能够充分证明对方公司的欠款事实。
- 咨询专业律师：虽然我已经为您提供了一些基本的法律建议，但具体的诉讼策略和操作还需要根据案件的具体情况来制定。因此，我建议您咨询一位专业的公司法务律师，以便更好地维护您的权益。
- 关注诉讼时效：确保您的诉讼没有超过法定的诉讼时效期间，否则您可能会失去胜诉权。
后续思考：
- 在诉讼过程中，您还需要关注对方公司的财务状况和经营状况，以便及时调整诉讼策略和应对可能出现的风险。
- 如果对方公司提出和解或调解的意愿，您可以考虑根据实际情况和对方的诚意来决定是否接受和解或调解，以尽快解决纠纷并降低诉讼成本。
如有其他疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。