结论：关于委托化妆品代生产时合同是否可以由公司的理事代签，这主要取决于公司章程、理事的授权情况以及相关法律法规的规定。一般情况下，如果理事获得了公司的合法授权，是可以代签合同的；但如果没有授权或授权不明确，则可能存在法律风险。以下从多个角度进行详细分析：

一、公司章程与内部授权

1. 公司章程规定：

   • 公司章程是公司的基本法律文件，其中可能规定了公司对外签订合同的权限和程序。如果公司章程明确规定了理事可以代表公司签订特定类型的合同（如化妆品代生产合同），并且该规定不违反法律法规的强制性规定，那么理事代签合同是合法的。

2. 内部授权程序：

   • 即使公司章程没有明确规定，公司也可以通过内部决议或授权书的形式，明确授予理事签订化妆品代生产合同的权限。在这种情况下，理事代签合同也是有效的。

二、法律法规的强制性规定

1. 《民法典》相关规定：

   • 根据《民法典》的相关规定，民事主体可以通过代理人实施民事法律行为。代理人在代理权限内，以被代理人名义实施的民事法律行为，对被代理人发生效力。因此，如果理事获得了公司的合法授权，其代签合同的行为是有效的。

2. 特殊行业规定：

   • 化妆品行业可能受到特定法律法规的监管，如《化妆品监督管理条例》等。这些法规可能对化妆品代生产合同的签订有特殊要求，如必须由法定代表人或特定授权人员签订等。因此，在签订化妆品代生产合同时，需要特别注意这些特殊规定。

三、法律风险与防范

1. 无权代理的风险：

   • 如果理事没有获得公司的合法授权而代签合同，可能构成无权代理。在这种情况下，合同对公司可能不发生效力，除非公司事后追认或相对人有理由相信理事有代理权（如表见代理）。

2. 防范措施：

   • 为避免法律风险，公司应明确授权程序，确保理事在代签合同前获得合法授权。同时，可以在合同中明确约定代理人的身份和权限，以及无权代理时的法律责任等。

四、实际操作建议

1. 审查公司章程和内部授权文件：

   • 在签订化妆品代生产合同前，应仔细审查公司章程和内部授权文件，确保理事具有代签合同的权限。

2. 明确合同条款：

   • 在合同中明确约定代理人的身份、权限以及无权代理时的法律责任等条款，以降低法律风险。

3. 咨询专业律师：

   • 如果对理事代签合同的合法性或合同条款存在疑问，建议咨询专业律师以获取更具体的法律建议。

总结来说，委托化妆品代生产时合同是否可以由公司的理事代签，取决于公司章程、理事的授权情况以及相关法律法规的规定。为确保合同的合法性和有效性，建议公司在签订前仔细审查相关文件并咨询专业律师。如果你有进一步的法律问题或需要更具体的法律建议，可以直接向我咨询。