结论概述：针对员工无视公司制度且多次投诉索要扣除工资的情况，公司可以通过完善制度、收集证据、内部处理、申请劳动仲裁或提起诉讼等方式来维权。

1. 完善公司制度与合同条款

• 制度完善：公司应确保有一套完善、合法且经过民主程序制定的规章制度，明确规定员工的职责、行为规范以及违反制度的处罚措施。这些制度应当公示或告知员工，确保员工知晓并同意遵守。
• 合同条款：在劳动合同中，公司可以明确约定员工应遵守的规章制度，以及违反规章制度时公司有权采取的处罚措施，包括扣除工资等。

2. 收集证据

• 违规证据：公司需要收集员工无视公司制度的具体证据，如监控录像、工作记录、同事证言等，以证明员工确实存在违规行为。
• 投诉证据：对于员工投诉索要扣除工资的情况，公司应保留相关投诉记录、沟通记录等，以证明公司扣除工资的合法性和合理性。

3. 内部处理

• 沟通教育：在采取处罚措施前，公司可以尝试与员工进行沟通，了解其违规原因，并进行教育引导，希望其能改正错误。
• 处罚决定：如果员工拒不改正，公司可以根据规章制度和劳动合同的约定，作出扣除工资等处罚决定，并书面通知员工。

4. 申请劳动仲裁

• 仲裁申请：如果员工对公司的处罚决定不服，向劳动仲裁委员会申请仲裁，公司可以积极应诉，提交相关证据和法律依据，证明公司处罚的合法性和合理性。
• 仲裁结果：劳动仲裁委员会将根据双方提供的证据和法律依据作出裁决。如果裁决支持公司的处罚决定，员工需要执行；如果裁决不支持，公司可能需要调整处罚措施或承担相应责任。

5. 提起诉讼

• 诉讼准备：如果劳动仲裁结果对公司不利，或者员工对仲裁结果不服向法院提起诉讼，公司可以准备相关证据和法律依据，积极应诉。
• 诉讼过程：在诉讼过程中，公司需要向法院提交证据，证明员工存在违规行为以及公司扣除工资的合法性和合理性。法院将根据双方提供的证据和法律依据作出判决。

6. 注意事项

• 合法合规：公司在处理员工违规行为时，必须确保所有措施都合法合规，不得侵犯员工的合法权益。
• 及时沟通：公司应与员工保持及时沟通，了解其想法和需求，尽量通过协商解决问题，避免矛盾升级。
• 专业咨询：如果公司在处理员工违规行为时遇到法律难题或不确定如何操作，可以向我咨询，我会根据具体情况提供专业的法律建议。

后续行动建议：公司应持续关注员工的违规行为情况，及时采取措施进行纠正和处理。同时，公司也应加强内部管理，完善制度建设，提高员工的法律意识和合规意识，从源头上减少违规行为的发生。如果有任何法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。