超面积建墓穴的处罚时效计算，需根据具体违法行为及法律适用条款综合判断，通常涉及行政处罚时效和追责期限两个层面。以下从不同角度展开分析：

1. 行政处罚时效的法律依据

根据《中华人民共和国行政处罚法》第三十六条，违法行为在二年内未被发现的，不再给予行政处罚；涉及公民生命健康安全、金融安全且有危害后果的，期限延长至五年。

• 超面积建墓穴若属于“违反土地管理、殡葬管理法规”的行为（如未经批准占用土地建墓），通常适用二年时效；
  
• 若该行为同时导致土地资源破坏、环境污染等严重后果，可能适用五年时效。
  关键点：时效从“违法行为发生之日”起算；若违法行为有连续或持续状态（如长期超面积占用），则从“行为终了之日”起算。

2. 追责期限的特殊情形

若超面积建墓穴行为涉嫌刑事犯罪（如非法占用农用地罪），则需依据《中华人民共和国刑法》第八十七条确定追诉期限：

• 法定最高刑为不满五年有期徒刑的，追诉期限为五年；
  
• 法定最高刑为五年以上不满十年有期徒刑的，追诉期限为十年。
  示例：若非法占用基本农田五亩以上，可能触犯刑法第三百四十二条，追诉期限为五年或十年，具体取决于情节严重程度。

3. 实务中的时效认定要点

• “被发现”的界定：行政机关通过日常巡查、群众举报、卫星遥感监测等方式发现违法行为，均视为“被发现”；
  
• 持续违法行为的处理：若墓穴建成后长期超面积占用土地（如未恢复原状），可能被认定为持续违法，时效从“恢复原状之日”起算；
  
• 地方性法规的补充：部分省份对殡葬管理有特殊规定（如《XX省殡葬管理条例》），可能细化超面积建墓穴的处罚标准，但不影响时效的基本计算规则。

4. 建议与风险提示

• 自查自纠：若已存在超面积建墓穴行为，建议尽快向当地民政、自然资源部门报告并补办手续，避免因时效问题被处罚；
  
• 证据保留：若认为行政处罚超过时效，可要求行政机关提供“违法行为发现时间”的证据（如立案通知书、检查记录等）；
  
• 法律救济：对处罚决定不服的，可在收到决定书之日起60日内申请行政复议，或6个月内提起行政诉讼。

如有具体案件细节（如建墓时间、土地性质、是否已被处罚等），可进一步向我咨询，我会结合地方规定和司法实践为您详细分析。