占用小区公共区域种树是否违法，需根据具体情况来判断。以下是对此问题的全面分析：
合法种植的情况
获得相关主体同意与批准：
- 若种植行为经过了小区业主大会或业主委员会的同意，并且得到了物业管理公司的许可，同时遵循了物业管理的相关规定，那么该种植行为通常是合法的。例如，小区为了美化环境，组织业主在公共区域种植树木，且事先征得了全体业主的同意，并办理了相关手续，这样的种植行为就是合法的。
- 在某些情况下，可能还需要获得相关政府部门的批准，如城市绿化管理部门等，以确保种植行为符合城市规划与绿化要求。
符合规划与安全标准：
- 种植行为应符合小区的整体规划，不得影响小区的消防设施、水电设施等公共设施的正常使用。比如，不能将树木种植在消防通道上，以免阻碍消防车辆的通行。
- 种植的树木应与建筑物、地下管线等保持足够的安全距离，以避免因树木生长而损坏这些设施或危及居民安全。例如，树木与建筑物之间应保持一定的距离，防止树木根系对建筑物基础造成破坏。
不侵害他人权益：
- 种植树木的行为不应遮挡阳光、影响通风等，从而损害其他业主的合法权益。比如，不能在低层业主的窗户前种植高大的树木，以免影响其采光和通风。
- 应确保树木的生长不会对其他业主的生活造成不便或影响。例如，树木的枝叶不应伸入其他业主的庭院或阳台，以免造成困扰。
违法种植的情况
违反物业管理规定：
- 如果小区有明确的物业管理规约，禁止业主在公共区域私自种植树木，而业主未经许可擅自种植，则违反了物业管理规定，可能会面临违约责任。比如，小区规约中明确规定公共区域不得私自种植树木，业主却擅自种植，物业管理公司有权要求其停止侵害并恢复原状。
影响公共安全与设施使用：
- 将树木种植在消防通道上或影响其他公共设施的正常使用，如阻碍道路通行、影响水电设施运行等，都是违法的。这种行为不仅可能受到物业管理公司的处罚，还可能面临相关政府部门的行政处罚。例如，根据《中华人民共和国消防法》的规定，任何单位、个人不得占用、堵塞、封闭疏散通道、安全出口、消防车通道，否则将面临警告或者五百元以下罚款的处罚。
违反法律法规的强制性规定：
- 种植国家保护植物或违反城市绿化管理、土地管理等法律法规的强制性规定，也是违法的。比如，私自种植国家一级保护植物，将触犯相关法律，并可能面临刑事责任。根据《中华人民共和国刑法》的规定，非法收购、运输、加工、出售国家重点保护植物、国家重点保护植物制品的，将面临三年以下有期徒刑、拘役或者管制，并处或者单处罚金；情节严重的，将面临三年以上七年以下有期徒刑，并处罚金。
建议与指导
- 在小区公共区域种植树木前，务必咨询相关部门和机构，如物业管理公司、城市绿化管理部门等，了解具体的种植规定与程序。
- 确保种植行为符合小区整体规划、安全标准及法律法规要求。比如，选择适合当地气候和土壤条件的树种，避免种植可能对公共设施造成破坏的树种。
- 与邻居沟通协商，确保种植行为不会损害他们的合法权益。比如，在种植前与相邻业主进行沟通，听取他们的意见和建议，避免因种植树木而引发邻里纠纷。
- 如遇纠纷或争议，应及时寻求法律途径解决，以维护自身和他人的合法权益。比如，可以向物业管理公司投诉、向相关部门举报或者通过诉讼等方式解决纠纷。
综上所述，占用小区公共区域种树的合法性需综合考虑多个因素，包括是否获得相关主体同意、是否符合规划与安全标准、是否侵害他人权益以及是否违反法律法规的强制性规定。因此，在进行种植行为前，务必进行充分的了解和准备，以避免不必要的法律风险和纠纷。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。