关于自行车车顶架是否合法的问题，这主要取决于您如何安装和使用它，以及是否符合相关的交通法规。

首先，根据《机动车运行安全技术条件》(GB7258-2017)以及《中华人民共和国道路交通安全法实施条例》的规定，载客汽车除车身外部的行李架和内置的行李箱外，不得载货。如果您打算在车顶加装行李架来携带自行车，那么需要确保行李架的安装和使用符合以下要求：

1. 高度限制：从车顶起高度不得超过0.5米，从地面起高度不得超过4米。这意味着，如果您将自行车放在车顶行李架上，必须确保自行车和行李架的总高度不超过这个限制。否则，将属于违法行为。

2. 安全性：车顶行李架应安装固定可靠，不应有任何可能使人致伤的尖锐凸起物（如尖角、锐边等）。这是为了确保在行驶过程中，行李架和自行车不会对其他车辆或行人造成伤害。

3. 备案要求：根据《机动车登记规定》，小型、微型载客汽车在不改变车身主体结构且保证安全的情况下加装车顶行李架，需要在信息或事项变更后三十日内，向登记地车辆管理所申请变更备案。这是为了确保您的车辆改装符合法规要求，并保障道路交通安全。

关于车顶能否直接放自行车：

• 直接在车顶行李架上放自行车，或者是在车尾安装支架放自行车，如果超过了上述的高度限制，都是违法的。
• 如果您确实想携带自行车出行，可以考虑将自行车放在内置行李箱内（如果空间允许的话），或者将自行车在车顶行李架上平放绑好，确保牢固且长宽不要超出车身，同时严格遵守高度限制。

总结建议：

• 在安装车顶行李架和携带自行车之前，请务必了解并遵守当地的交通法规。
• 确保行李架的安装牢固可靠，并符合高度和安全性的要求。
• 如果进行了车辆改装（如加装车顶行李架），请及时向车辆管理所申请变更备案。
• 考虑使用更安全、合规的方式来携带自行车，如使用内置行李箱或选择符合规定的车顶行李架和固定方式。

希望这些解答能够帮助您更好地理解自行车车顶架的合法性问题，并确保您的出行安全合规。