交通运输局对公交司机确实具有行政处罚权。以下是从不同角度对此问题的详细分析：
行政处罚权的来源：
- 交通运输局作为交通管理部门，其行政处罚权来源于《中华人民共和国道路交通安全法》等相关法律法规的授权。这些法律明确规定了交通管理部门对违反交通管理秩序的行为人（包括公交司机）有权进行行政处罚。
行政处罚的对象与范围：
- 行政处罚的对象是违反交通管理秩序的行为人，这自然包括了公交司机。当公交司机在驾驶过程中违反交通规则，如闯红灯、超速行驶、不按规定路线行驶等，交通运输局有权对其进行行政处罚。
- 行政处罚的范围涵盖了多种交通违法行为，具体处罚措施包括但不限于警告、罚款、暂扣或吊销机动车驾驶证等。
行政处罚的合法性与程序：
- 交通运输局在行使行政处罚权时，必须严格遵循法定程序，包括调查取证、告知处罚事实与理由、听取当事人的陈述与申辩、作出处罚决定等。
- 处罚决定应当基于充分的事实和法律依据，确保处罚的合法性与公正性。如果公交司机对处罚决定不服，可以依法申请行政复议或提起行政诉讼。
公交司机与公交公司的关系：
- 需要注意的是，公交公司本身并不具有行政处罚权。公交公司对公交司机的管理主要基于内部规章制度和劳动合同约定，可以采取纪律处分、经济赔偿等合法手段，但不能进行行政处罚。
- 如果公交司机因违反公司规章制度或劳动合同约定而受到处罚，这属于公司内部管理范畴，与交通运输局的行政处罚是两个不同的概念。
实际例子：
- 假设某公交司机在驾驶过程中闯红灯，被交通运输局的执法人员当场查获。根据《中华人民共和国道路交通安全法》的相关规定，交通运输局有权对该司机处以罚款、记分等行政处罚。
- 如果该司机因违反公司规章制度（如未按规定时间出车）而受到公交公司的处罚，这属于公司内部管理行为，与交通运输局的行政处罚无关。
法律建议：
- 作为公交司机，应严格遵守交通规则，避免受到交通运输局的行政处罚。
- 如果对处罚决定有异议，应及时咨询专业律师，了解自己的权利与义务，并依法申请行政复议或提起行政诉讼。
- 公交公司也应建立健全内部规章制度，明确对司机的管理要求与处罚措施，确保公司内部管理的合法性与有效性。
综上所述，交通运输局对公交司机具有行政处罚权，这是基于相关法律法规的授权。公交司机应严格遵守交通规则，避免违法行为的发生；同时，如果对处罚决定有异议，也应依法维护自己的合法权益。如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。