结论：要证明个体工商户虽登记为个人经营但实际是夫妻共同经营，进而让夫妻双方共同承担责任，可从经营资金来源、经营决策参与、经营收益分配、实际经营行为等多个方面收集证据来证明。

1. 经营资金来源
   • 若个体工商户的经营资金主要来源于夫妻共同财产，例如夫妻共同存款投入经营，或者以夫妻共同财产购置经营所需的设备、原材料等，这可以作为一个重要证据表明夫妻双方都参与了经营。比如，银行转账记录显示，用于购买店铺货物的资金是从夫妻共同的银行账户中支出的，这就说明经营资金与夫妻共同财产有关联，暗示夫妻共同经营。
   • 另外，如果夫妻一方为经营向他人借款，且该借款被用于个体工商户的经营活动，同时另一方知晓并认可该借款行为，也可视为夫妻共同经营的一种体现。例如，丈夫以个人名义向朋友借款用于店铺装修，妻子在借款过程中知晓并同意，且后续也参与了店铺的经营决策，这种情况下可认定夫妻共同经营。
2. 经营决策参与
   • 收集能证明夫妻双方都参与经营决策的证据。例如，在重要的经营合同签订过程中，夫妻双方都参与了谈判、决策过程，有相关的会议记录、聊天记录或者证人证言可以证明。比如，在签订一份长期供货合同时，夫妻双方与供货方进行了多次协商，讨论合同条款，最终共同决定签订合同，这些协商的记录以及在场人员的证言都能说明夫妻双方都参与了经营决策。
   • 对于个体工商户的重大经营事项，如店铺的扩张、转型、关闭等决策，若夫妻双方都有参与讨论并做出决定，也可以作为共同经营的证据。例如，夫妻双方共同决定将原本的小店铺扩大规模，租下更大的店面，并进行了装修和设备更新，相关的决策讨论记录、租赁合同、装修合同等都能支持夫妻共同经营的观点。
3. 经营收益分配
   • 如果个体工商户的经营收益是用于夫妻共同生活，或者按照夫妻双方的约定进行分配，这可以表明夫妻双方都从经营中受益，从而间接证明是共同经营。例如，店铺的经营收入直接存入夫妻共同的银行账户，用于家庭的日常开支、子女教育、购房等，这显示了经营收益与夫妻共同生活的紧密联系。
   • 另外，若夫妻双方有关于经营收益分配的书面协议或口头约定，并且能够提供相关证据证明该约定的存在和执行情况，也能有力地证明夫妻共同经营。比如，夫妻双方约定经营利润按照一定比例分配，且有相关的转账记录或账目记录显示按照约定进行了分配。
4. 实际经营行为
   • 收集夫妻双方实际参与经营活动的证据，如一方负责采购，另一方负责销售；或者一方负责财务管理，另一方负责客户服务等。例如，有供应商的证言证明经常与夫妻双方中的一人联系采购事宜，同时有客户的反馈表明与另一方进行业务沟通和售后服务，这可以说明夫妻双方在不同环节都参与了经营。
   • 店铺的考勤记录、工作安排记录等也能反映夫妻双方的实际经营行为。如果考勤记录显示夫妻双方都有在店铺工作的时间记录，工作安排记录中有关于双方分工的明确记载，这些都是证明夫妻共同经营的有力证据。