医师多点备案执业是合法的。这一结论主要基于以下几点详细解释：

首先，从法律层面来看，我国《执业医师法》为医师多点执业提供了法律基础。虽然该法规定医师需在注册的执业地点、执业类别、执业范围内执业，但并未禁止医师在多个地点注册执业。实际上，随着医疗改革的深入，国家政策逐步放宽了对医师多点执业的限制，以促进优质医疗资源的合理流动和科学配置。

其次，国家卫生计生委等五部门联合印发的《关于推进和规范医师多点执业的若干意见》明确提出了推进和规范医师多点执业的总体要求、主要条件和注册管理等方面的规定。该意见允许临床、口腔和中医类别医师多点执业，并明确了多点执业的医师应具备的条件，如具有中级及以上专业技术职务任职资格、从事同一专业工作满5年等。同时，该意见还简化了注册程序，探索实行备案管理和区域注册，为医师多点执业提供了便利。

再者，医师多点执业对于医疗卫生事业的发展具有积极作用。它有助于更好地统筹调配医疗卫生资源，调动医务人员积极性，促进区域间、机构间人员和技术的交流，提高基层医院诊疗技术水平，方便人民群众特别是基层群众看病就医，减轻群众就医负担。因此，国家政策鼓励医师到基层、边远地区、医疗资源稀缺地区和其他有需求的医疗机构多点执业。

最后，虽然医师多点执业合法且具有诸多优势，但也需要加强监管以确保医疗质量和医疗安全。多点执业医师需与各执业地点医疗机构签订聘用（劳动）合同和劳务协议，明确各自的权利和义务。同时，医疗机构和医师应购买医疗责任保险等医疗执业保险，以应对可能发生的医疗风险。

综上所述，医师多点备案执业是合法的，且符合国家政策导向和医疗卫生事业发展的需要。然而，在实施过程中，也需加强监管以确保医疗质量和医疗安全。