在小区楼顶设置养鸡场，主要违背了以下法律法规及相关规定：
《中华人民共和国治安管理处罚法》的相关规定：
- 根据该法第七十五条，饲养动物若干扰他人正常生活，将受到警告处罚；若警告后不改正，或放任动物恐吓他人，则可能面临二百元以上五百元以下的罚款。在小区楼顶养鸡，鸡的叫声、气味等很可能干扰到其他居民的正常生活，因此这一行为可能违反此条款。
物业管理及城市规划相关法规：
- 小区楼顶通常属于公共区域，其使用应遵循物业管理规定及城市规划要求。在楼顶设置养鸡场，很可能未经其他业主同意，也未获得相关管理部门的批准，从而违反了物业管理规定。
- 同时，城市规划中对于建筑物的使用功能有明确规定，楼顶一般不被规划为养殖用途。因此，在楼顶养鸡也可能违反了城市规划的相关规定。
环境保护及卫生防疫相关法规：
- 养鸡场可能产生噪音、异味等污染，影响小区环境。根据环境保护相关法规，任何单位和个人都有义务保护环境，防止污染。因此，在小区楼顶养鸡可能违反了环境保护的相关规定。
- 此外，养鸡场还可能成为疾病传播的源头，对小区居民的健康构成威胁。根据卫生防疫相关法规，对于可能传播疾病的场所和活动，应进行严格的监管和控制。因此，在小区楼顶养鸡也可能违反了卫生防疫的相关规定。
法律后果与建议：
- 若因小区楼顶养鸡场引发纠纷，相关责任人可能面临治安管理处罚、物业管理处罚以及环境保护和卫生防疫方面的处罚。
- 对于受到干扰的居民，可以首先尝试与养鸡场主进行协商，要求其停止养鸡或采取措施减少干扰。若协商无果，可以向物业管理公司或相关部门投诉，寻求帮助。
- 若问题仍未得到解决，居民可以考虑通过法律途径维护自己的合法权益，如向法院提起诉讼，要求养鸡场主停止侵害、排除妨碍或赔偿损失等。
总结与提醒：
小区楼顶养鸡场不仅可能违反多项法律法规，还可能对小区居民的生活质量和健康造成不良影响。因此，建议居民在遇到此类问题时，及时采取措施维护自己的合法权益，并向相关部门反映情况，共同维护小区的良好环境和秩序。如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。