食品药品监督部门在特定情况下有权扣车。

首先，我们需要明确，食品药品监督部门的主要职责是确保食品、药品的质量和安全，保护消费者的合法权益。在履行这一职责的过程中，他们可能会遇到需要采取强制措施的情况，以防止不合格或存在安全隐患的食品、药品流入市场。

具体来说，如果食品药品监督部门在检查过程中发现某车辆正在运输不合格或存在安全隐患的食品、药品，且该行为可能严重危害公众健康或安全，那么他们有权依据相关法律法规采取扣押车辆的强制措施。这一措施的目的是为了防止问题产品进一步扩散，保护消费者的合法权益。

当然，食品药品监督部门在采取扣押车辆等强制措施时，必须严格遵守相关法律法规的规定，确保程序的合法性和正当性。同时，他们也需要对扣押的车辆和物品进行妥善保管，并及时处理相关事宜。

总之，食品药品监督部门在特定情况下有权扣车，但这是基于保护公众健康和安全的需要，并且必须严格遵守法律法规的规定。如果你对此类问题有进一步的疑问或需要更详细的法律解释，请随时向我咨询。