您好，关于企业破产财产被抵押时员工补偿的计算问题，这是一个涉及法律、经济和社会保障的复杂问题。以下是我为您详细梳理的解答：
一、法律依据与补偿原则
在中国，企业破产时职工补偿的主要法律依据是《中华人民共和国企业破产法》以及相关的劳动法律法规。这些法律规定了企业在破产清算过程中应如何对待职工权益，特别是经济补偿金的支付。根据法律，职工权益在破产清算中具有优先性，即破产财产在优先清偿破产费用和共益债务后，应首先用于支付职工的工资、医疗、伤残补助、抚恤费用，以及应当划入职工个人账户的基本养老保险、基本医疗保险费用，还有法律、行政法规规定应当支付给职工的补偿金。
二、经济补偿金的计算
计算依据：
- 经济补偿按劳动者在本单位工作的年限，以每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。
- 六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。
- 月工资是指劳动者在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资。若劳动者月工资高于用人单位所在直辖市、设区的市级人民政府公布的本地区上年度职工月平均工资三倍的，向其支付经济补偿的标准按职工月平均工资三倍的数额支付，且向其支付经济补偿的年限最高不超过十二年。
计算实例：
- 假设某职工在某企业工作了5年8个月，其月工资为5000元，且该职工月工资未超过当地职工月平均工资的三倍。那么，该职工在企业破产时应获得的经济补偿金为：6年（工作年限，六个月以上不满一年的按一年计算）× 5000元/年（月工资）= 30000元。
三、其他相关费用的处理
社会保险与住房公积金：
- 企业需补缴拖欠的社会保险费和住房公积金至破产清算日，确保员工社保权益不受影响。
未休年假补偿：
- 对于未安排年休假的员工，企业应依法支付未休年假的工资报酬，标准为日工资的200%（已包含正常工资）。
代通知金（如适用）：
- 若企业未提前三十日以书面形式通知员工解除劳动合同，则需额外支付一个月工资作为代通知金。但需注意，此条款主要适用于非破产情境下的经济性裁员，破产清算中是否适用需结合具体案情判断。
四、特殊情形下的补偿调整
高管薪酬限制：
- 企业董事、监事和高级管理人员的工资按照该企业职工的平均工资计算，以避免过度补偿。
协商机制：
- 在破产管理人监督下，企业与员工可通过集体协商调整补偿方案，但需确保不低于法定最低标准。
五、补偿流程与注意事项
申报债权：
- 员工需在法院指定的债权申报期限内向破产管理人提交工资、补偿金等债权证明材料。
优先受偿：
- 职工债权在破产财产分配中享有第一顺位优先权，但需注意区分普通债权与有财产担保债权的清偿顺序差异。在抵押财产的情况下，有财产担保的债权可能优先于职工债权受偿，但职工债权仍会在剩余财产中优先受偿。
法律救济途径：
- 对补偿金额或程序存在异议的员工，可依法向法院提起诉讼或申请仲裁，维护自身合法权益。
综上所述，企业破产财产被抵押时，员工的补偿计算主要依据《中华人民共和国企业破产法》及相关劳动法律法规。员工应关注自己的工作年限、月工资水平以及破产清算的具体情况，及时申报债权并保留相关证据，以维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时咨询。