当摩托车与电动车相撞后车辆被交警扣押时，您可以按照以下步骤来妥善处理这一情况：
一、了解扣车原因
首先，您需要明确车辆被扣押的具体原因。交警在扣车时会出具扣车凭证或处罚通知书，上面会详细注明扣车的具体原因，如涉及交通事故、车辆手续不全、违反交通法规等。请仔细查看这份凭证，并妥善保管，以便后续处理。
二、配合交警调查
提供必要信息：在交警调查过程中，您需要如实提供事故发生的时间、地点、经过以及您的个人信息、车辆信息等。同时，也要提供对方的相应信息，以便交警全面了解事故情况。
接受询问：交警可能会对您进行询问，了解事故发生的细节。请如实回答，不要隐瞒或提供虚假信息，以免影响事故责任的认定。
协助勘查现场：如果交警需要您协助勘查事故现场，如指出车辆位置、碰撞部位等，请积极配合，以便交警准确判断事故责任。
三、等待责任认定
交警会根据现场勘查、询问当事人及证人等情况，依据相关法律法规对事故责任进行认定。责任划分可能包括全部责任和无责任、主要责任和次要责任、同等责任等。在等待责任认定的过程中，请保持耐心，不要急于自行处理车辆或与对方协商赔偿事宜。
四、处理后续事宜
接收责任认定书：一旦交警作出责任认定，您会收到事故责任认定书。请仔细阅读认定书上的内容，了解自己的责任和对方的责任。
通知保险公司：根据责任认定书，及时向各自的保险公司报案，提供事故责任认定书、照片等相关资料。保险公司会安排定损员评估车辆损失，并根据保险合同约定进行赔偿。
协商赔偿事宜：双方可就赔偿事宜进行协商，包括车辆维修费用、医疗费用、误工费等。如果协商不成，可以申请交警部门进行调解，或者寻求专业律师的帮助，通过法律途径解决赔偿纠纷。
取回车辆：在完成所有处罚和手续后（如缴纳罚款、接受处理等），根据交警部门的指示，前往指定的停车场办理取车手续。取车时，请仔细检查车辆外观和部件是否与扣车时一致，如有问题及时与停车场管理人员沟通。
五、注意事项
保持冷静与配合：在整个处理过程中，请保持冷静，积极配合交警部门的工作，依法依规解决问题。不要与交警发生争执或冲突，以免加重处罚或影响事故处理进度。
加强交通安全意识：为了避免类似情况再次发生，建议您加强交通安全意识，严格遵守道路交通安全法律、法规，确保车辆具备合法手续，并定期进行安全检查和维护。
及时申诉：如果您对交警的处罚决定或责任认定有异议，务必在规定时间内通过合法途径进行申诉，维护自己的合法权益。
综上所述，当摩托车与电动车相撞后车辆被交警扣押时，您需要了解扣车原因、配合交警调查、等待责任认定、处理后续事宜，并注意相关事项。希望这些建议能帮助您妥善处理这一情况。