针对您提出的“非法经营12万只卷烟怎么处罚”的问题，以下是我根据相关法律法规及司法实践，为您提供的详细解答：
一、法律依据
首先，我们需要明确的是，非法经营卷烟的行为主要依据《中华人民共和国刑法》第二百二十五条关于非法经营罪的规定进行处罚。该条款明确指出，未经许可经营法律、行政法规规定的专营、专卖物品或者其他限制买卖的物品，扰乱市场秩序，情节严重的，构成非法经营罪。
二、量刑标准与“情节严重”的认定
“情节严重”的标准：
- 根据《最高人民法院、最高人民检察院关于办理非法生产、销售烟草专卖品等刑事案件具体应用法律若干问题的解释》，非法经营烟草专卖品的“情节严重”标准包括非法经营数额在五万元以上，或违法所得数额在二万元以上，以及非法经营卷烟二十万支以上等情形。
- 在您的情况下，非法经营卷烟的数量虽未直接提及，但非法经营数额已达12万元，这明显超过了“情节严重”中非法经营数额五万元的标准。
量刑幅度：
- 对于构成“情节严重”的非法经营罪，量刑幅度通常为五年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处违法所得一倍以上五倍以下罚金。
三、影响量刑的具体因素
在确定基本量刑幅度后，法院还会综合考虑以下因素来具体确定刑罚：
- 主观故意：犯罪嫌疑人是否存在明知故犯、故意违法的情况。
- 前科记录：是否有类似犯罪的前科，以及是否构成累犯，这会影响法院对犯罪嫌疑人主观恶性的判断。
- 自首与立功：如果犯罪嫌疑人主动投案自首，或者有协助抓捕其他犯罪嫌疑人等立功表现，法院可能会考虑减轻处罚。
- 退赃退赔：犯罪嫌疑人是否积极退还非法所得，或者赔偿受害方的损失，这也是法院量刑时的重要考虑因素。
四、具体刑罚与建议
具体刑罚：
- 结合上述分析，非法经营卷烟数额达到12万元，犯罪嫌疑人可能被判处五年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处违法所得一倍以上五倍以下罚金。具体刑罚将由法院根据案件具体情况综合判断后确定。
建议：
- 面对此类法律问题，我建议您尽快寻求专业律师的帮助。律师能够为您提供更详细的法律咨询，帮助您了解自己的法律责任和可能的法律后果。
- 同时，您应积极准备相关证据材料，如非法经营的账目、交易记录等，以便在法律程序中更好地维护自己的合法权益。
- 如果您有自首、立功或退赃退赔等情节，也应及时向律师和法院说明，以争取可能的减轻处罚。
希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的法律咨询，请随时告诉我。