违建的认定部门主要包括城乡规划主管部门、土地管理部门、建设主管部门、城管（城市综合执法）部门，以及特定情况下的乡（镇）人民政府、国土资源部门和水利部门。以下是对这些部门的详细分析：

1. 城乡规划主管部门：

   • 主要职责：负责城市、镇规划区内建筑物、构筑物等工程建设的规划管理。对于未取得或未按建设工程规划许可证进行的建设，该部门有权进行认定和处理。
   • 法律依据：根据《中华人民共和国城乡规划法》的相关规定，县级以上地方人民政府城乡规划主管部门负责处理此类违建。
   • 实例说明：如城市居民未经许可搭建阳光房，城乡规划主管部门将依据城市规划进行认定。

2. 土地管理部门（或自然资源部门）：

   • 主要职责：专注于土地管理法律法规的遵守情况。对于违反土地管理法规，非法占用土地进行建设的行为，土地管理部门（或自然资源部门，根据最新机构改革，部分职能已整合至自然资源部门）有权进行认定和处理。
   • 法律依据：基于土地利用总体规划、土地用途管制等规定。
   • 实例说明：如企业未经批准占用农用土地建设厂房，土地管理部门（或自然资源部门）将依据相关规定进行认定。

3. 建设主管部门：

   • 主要职责：负责建筑工程建设过程的监管，包括施工许可、工程质量等方面。在建设过程中，如发现违法建设行为，建设主管部门将参与认定和处理。
   • 实例说明：若某建筑在施工过程中违反了建筑安全规范，建设主管部门将有权进行认定并要求整改。

4. 城管（城市综合执法）部门：

   • 主要职责：在许多地方，城管部门通过相对集中行政处罚权的方式，被赋予认定并查处城市规划区内违章建筑的职责。城管部门负责城市管理和行政执法工作，对城市建成区内的各类违法建设行为进行监管和认定。
   • 实例说明：如城管部门在日常巡查中发现沿街商铺私自扩建门面，将进行调查和认定，并依法进行处理。

5. 乡（镇）人民政府：

   • 主要职责：在乡、村庄规划区内，由乡、镇人民政府负责认定违章建筑。对于未依法取得乡村建设规划许可证或未按许可证规定进行建设的建筑物，乡镇政府有权进行认定和处理。
   • 法律依据：同样依据《中华人民共和国城乡规划法》，乡（镇）人民政府可责令停止建设、限期改正，逾期不改则可拆除。
   • 实例说明：如乡村村民未经许可建设养殖场，乡（镇）人民政府将依据乡村规划进行认定和处理。

6. 特定情况下的其他部门：

   • 国土资源部门（已整合至自然资源部门）：在涉及非法占用土地建设建筑的情况下，原国土资源部门（现相关职能已整合至自然资源部门）承担认定和处理责任。
   • 水利部门：对于在河道管理范围内违法建设建筑物、构筑物等影响行洪安全的行为，水利部门依据相关法律法规进行认定和处理。

综合建议：

• 面临违建问题时，首先应明确违建的具体地点、性质和违反的法律法规，以确定负责认定的主管部门。
• 在处理违建问题时，务必遵循相关法律法规，避免违规操作带来的法律风险和经济损失。
• 如果您对违建问题存在疑问或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律指导。