结论前置：员工拿走自己的劳动合同本身并不违法，但需根据具体情况谨慎处理，以避免潜在的法律风险或误会。
一、员工持有劳动合同的合法性
根据《中华人民共和国劳动合同法》第十六条的规定，劳动合同文本应由用人单位和劳动者各执一份。这是法律明确赋予劳动者的权利，旨在保障双方的合法权益，确保劳动者在需要时能够提供劳动关系、工作内容、工资待遇等相关事宜的证据。因此，员工拿走属于自己的那份劳动合同是合法且合理的。
二、不同情况下的应对方式
若用人单位未给员工合同：
- 在这种情况下，用人单位的行为违反了法律规定，员工有权要求用人单位提供劳动合同。若用人单位拒绝，员工可以向劳动行政部门投诉，用人单位可能面临责令改正及承担因违法行为给劳动者造成损害的赔偿责任。
若员工拿走两份合同：
- 员工拿走两份合同（即用人单位和劳动者各执一份的合同）可能涉及不当行为。用人单位应首先尝试与员工友好沟通，说明留存合同的管理需要和存档用途，请求员工归还多余的合同。
- 若员工拒绝归还，用人单位应收集和保存与该员工相关的其他证据，如工资发放记录、考勤记录、工作证、工作邮件等，以证明双方的劳动关系和相关约定。这些证据在必要时可以作为法律诉讼的依据。
若员工拿走合同可能有不良意图：
- 如果用人单位怀疑员工拿走合同是为了进行不法行为，如泄露商业秘密、敲诈勒索等，应立即提高警惕，并收集和保存与该员工相关的所有证据。
- 在这种情况下，用人单位可以根据具体情形采取相应的法律措施，如向公安机关报案、提起劳动仲裁或诉讼等，以维护自身权益。
三、沟通与预防
- 沟通：为避免不必要的误会和法律纠纷，建议员工在拿走自己的劳动合同时，最好事先与公司进行沟通，说明自己的需求和意图。
- 预防：公司也可以在劳动合同中明确约定关于合同保管和使用的相关条款，如合同应由双方各执一份、不得擅自复制或泄露合同内容等，以增强双方的法律意识和责任感。
四、总结与建议
员工拿走自己的劳动合同本身并不违法，但用人单位应关注员工拿走合同的具体情况和动机。在发现员工拿走合同后，用人单位应及时采取措施，如沟通、收集证据等，以确保自身的合法权益不受损害。同时，加强内部管理，规范合同签订和保管流程，也是预防此类问题发生的有效手段。
最后提醒：如果您在劳动工伤或合同纠纷方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。我将根据您的具体情况，提供专业、全面的法律建议。