核心前提：租客逾期三年未交房租，且在经营期间有借款行为，现需明确房租逾期与借款的法律关系及处理方式。

1. 关于房租逾期问题
   根据《民法典》第七百二十二条，承租人无正当理由未支付或迟延支付租金，出租人可要求其在合理期限内支付；逾期不支付的，出租人有权解除合同。

   • 若合同明确约定逾期支付租金的违约责任（如违约金、滞纳金），出租人可依据合同主张权利；
     
   • 若逾期三年未交房租，出租人可单方解除租赁合同，并要求租客腾退房屋、补缴租金及承担违约责任；
     
   • 若租客拒不履行，出租人可通过诉讼或申请强制执行追讨欠款。

2. 关于租客经营期间借款问题
   借款行为与房租逾期属于不同法律关系，需分情况处理：

   • 若借款与租赁无关（如租客以个人名义向第三方借款）：
     借款合同仅约束借款人与出借人，出租人无权直接主张权利。但若租客将借款用于支付房租，需提供证据证明资金流向，否则难以直接抵扣租金。
     
   • 若借款与租赁相关（如租客向出租人借款用于经营，并约定以租金抵扣）：
     需审查借款合同条款。若合同明确约定“借款抵租”，则出租人可主张抵销；若未约定，需双方协商或通过诉讼解决。
     
   • 若租客借款后失联或无力偿还：
     出借人可依据借款合同起诉租客，但出租人无直接追偿权。若租客财产不足以清偿所有债务，出租人作为房东可优先主张租金债权（需通过诉讼确认债权并参与分配）。

3. 综合建议

   • 出租人：
     
     1. 立即发函催告租客支付租金，明确解除合同的意思表示；
        
     2. 收集租赁合同、催缴记录、租客经营证据（如营业执照、借款合同等），为诉讼做准备；
        
     3. 若租客有财产（如设备、存货），可申请诉前财产保全，防止资产转移。
        
   • 出借人（若您是出借人）：
     
     1. 审查借款合同条款，确认还款期限、担保措施（如有）；
        
     2. 若租客逾期未还，尽快起诉并申请强制执行，同时关注租客财产状况；
        
     3. 若租客与出租人存在纠纷，可申请作为第三人参与诉讼，维护自身权益。

提示：法律关系复杂，建议携带合同文本、催缴记录等材料进一步咨询，以便精准分析。