农村排水工程先施工后招标一般是不合法的。下面我将从多个角度为你详细分析：
法律角度
根据《中华人民共和国招标投标法》的相关规定，在中华人民共和国境内进行下列工程建设项目包括项目的勘察、设计、施工、监理以及与工程建设有关的重要设备、材料等的采购，必须进行招标：
- 大型基础设施、公用事业等关系社会公共利益、公众安全的项目；
- 全部或者部分使用国有资金投资或者国家融资的项目；
- 使用国际组织或者外国政府贷款、援助资金的项目。
农村排水工程，作为基础设施项目，且往往涉及公共利益和公众安全，通常属于必须进行招标的范畴。如果未经招标程序就直接施工，这明显违反了上述法律规定，属于违法行为。
实际操作与后果角度
- 合同效力问题：先施工后招标的做法可能导致后续签订的施工合同因违反法律强制性规定而被认定为无效。这不仅会影响工程的顺利进行，还可能给双方带来不必要的法律纠纷和经济损失。
- 行政处罚风险：对于违反招标投标法的行为，相关行政主管部门有权进行处罚，包括罚款、责令改正等。这将对工程的进度和成本产生不利影响。
- 工程质量与安全风险：未经招标程序选择的施工单位，其资质、信誉和施工能力可能无法得到保证。这增加了工程质量问题和安全事故的风险，对农村排水工程的长期运行和村民的生活安全构成威胁。
特殊情况与例外
虽然一般情况下农村排水工程必须招标，但也存在一些特殊情况或例外。例如，如果工程属于紧急抢险救灾项目，或者涉及国家安全、国家秘密等特殊情况，可能可以不经招标程序直接施工。但这些情况都有严格的法律程序和审批要求，不是随意可以认定的。
建议：
- 严格遵守法律法规：在农村排水工程的建设过程中，应严格遵守招标投标法等相关法律法规的规定，确保工程的合法性和合规性。
- 提前规划招标程序：在工程启动前，应提前规划好招标程序，确保有足够的时间进行招标、评标和签订合同等工作。
- 咨询专业法律人士：如果对招标投标法等相关法律法规不熟悉或存在疑问，建议咨询专业法律人士的意见，以确保工程的顺利进行和合法合规。
如果你在农村排水工程或其他建设工程领域遇到法律问题，可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律意见和帮助。