当公司注册地和经营地不一致时，若需进行仲裁，核心在于确定仲裁机构的选择及仲裁协议的效力，以下从这两个方面进行详细说明：
一、仲裁机构的选择
仲裁协议约定：
- 若双方在合同中明确约定了仲裁条款，且该条款合法有效，则应按照仲裁条款的约定选择仲裁机构。仲裁条款通常会明确指定一个具体的仲裁机构，如“中国国际经济贸易仲裁委员会”或“某地仲裁委员会”等。
- 关键点：仲裁协议是仲裁机构受理案件的前提，没有仲裁协议或仲裁协议无效，仲裁机构将不予受理。
无仲裁协议或仲裁协议不明确：
- 若双方未签订仲裁协议，或仲裁协议对仲裁机构的选择不明确、存在争议，则无法直接通过仲裁解决纠纷。此时，双方需协商补充仲裁协议或选择其他争议解决方式，如诉讼。
- 特殊情况：若双方均同意由某一仲裁机构仲裁，且该仲裁机构同意受理，则也可进行仲裁。但这种情况较为少见，通常需要双方有明确的合意。
经营地与仲裁机构的关系：
- 仲裁机构的选择并不直接受公司经营地的影响。仲裁机构受理案件主要依据的是仲裁协议，而非公司的经营地或注册地。
- 建议：在选择仲裁机构时，可考虑仲裁机构的知名度、专业性、仲裁规则及仲裁员队伍等因素，以确保仲裁的公正性和效率。
二、仲裁协议的效力
仲裁协议的形式与内容：
- 仲裁协议应当采用书面形式，并明确约定仲裁事项、选定的仲裁委员会等关键内容。仲裁协议的内容应当清晰、明确，避免产生歧义。
- 法律依据：根据《中华人民共和国仲裁法》第十六条，仲裁协议应当具有下列内容：（一）请求仲裁的意思表示；（二）仲裁事项；（三）选定的仲裁委员会。
仲裁协议的效力确认：
- 若双方对仲裁协议的效力产生争议，可请求仲裁委员会作出决定或请求人民法院作出裁定。一方请求仲裁委员会作出决定，另一方请求人民法院作出裁定的，由人民法院裁定。
- 关键点：仲裁协议的效力是仲裁机构受理案件的基础，若仲裁协议无效，则仲裁机构将不予受理，纠纷需通过其他方式解决。
仲裁协议与诉讼的关系：
- 若仲裁协议有效，则双方应按照仲裁协议的约定选择仲裁解决纠纷，不得再向人民法院起诉。
- 例外情况：若一方在仲裁庭首次开庭前未对仲裁协议的效力提出异议，而后向人民法院起诉的，人民法院将不予受理，除非仲裁协议无效。
三、实际操作建议
审查仲裁协议：
- 在决定进行仲裁前，应仔细审查仲裁协议的内容，确保仲裁协议合法有效且明确约定了仲裁机构。
咨询专业律师：
- 若对仲裁协议的效力或仲裁机构的选择存在疑问，建议咨询专业律师，以获取准确的法律意见和指导。
准备仲裁材料：
- 若决定进行仲裁，应准备充分的仲裁材料，包括仲裁协议、合同、证据材料等，以确保仲裁的顺利进行。
总结来说，当公司注册地和经营地不一致时，若需进行仲裁，应首先审查仲裁协议的内容，确保仲裁协议合法有效且明确约定了仲裁机构。若仲裁协议有效且明确，则应按照仲裁协议的约定选择仲裁机构进行仲裁。若对仲裁协议的效力或仲裁机构的选择存在疑问，建议直接向我咨询，以获取准确的法律意见和指导。