非法居留案件中的侵害关系主要涉及非法居留者与国家（或具体地说，是国家的出入境管理机关）之间的法律关系。以下是对这一问题的详细分析：

1. 非法居留的定义与性质：

   • 非法居留通常指的是外国人在中国境内没有合法有效的居留证件，或者超出居留证件规定的期限、范围而继续居留的行为。
   • 这种行为违反了国家的出入境管理法规，因此具有违法性。

2. 侵害关系的主体：

   • 在非法居留案件中，侵害关系的主体一方是非法居留者，他们通过违反出入境管理法规，侵犯了国家的出入境管理秩序。
   • 另一方则是国家，具体表现为国家的出入境管理机关，如公安局出入境管理处等，它们负责维护国家的出入境管理秩序，对非法居留行为进行查处。

3. 侵害关系的具体内容：

   • 非法居留者通过其违法行为，破坏了国家的出入境管理秩序，这种秩序是国家为了维护社会稳定、公共安全以及国际关系等而制定的。
   • 国家的出入境管理机关则有权对非法居留行为进行调查、处罚，包括罚款、拘留、遣送出境等措施，以恢复被破坏的出入境管理秩序。

4. 法律后果：

   • 对于非法居留者，一旦被发现，将面临法律的制裁，包括但不限于罚款、拘留、强制遣送出境等。
   • 同时，非法居留行为也可能对非法居留者未来的签证申请、入境等产生不良影响，因为他们的违法行为会被记录在案。

5. 特殊情况下的侵害关系：

   • 在某些特殊情况下，非法居留行为还可能涉及其他法律关系，如非法居留者与雇主之间的劳动关系（如果非法居留者在中国境内工作）。但这种情况下的侵害关系主要关注的是劳动关系本身，而非非法居留行为本身对国家出入境管理秩序的侵害。
   • 另外，如果非法居留者在中国境内从事了其他违法行为，如盗窃、诈骗等，那么他们还将面临与这些违法行为相关的法律责任。

总结与建议： 非法居留案件中的侵害关系主要关注的是非法居留者与国家出入境管理机关之间的法律关系。非法居留行为违反了国家的出入境管理法规，破坏了国家的出入境管理秩序，因此将面临法律的制裁。如果你或你身边的人涉及非法居留问题，建议尽快向专业的法律人士（如我，何海洋律师，专注于医疗纠纷、刑事辩护领域，但同样对出入境管理法规有深入了解）咨询，以便了解具体的法律后果和应对策略。