在合同中，违约金和滞纳金在合法性上并无绝对的优劣之分，关键在于它们是否符合法律法规的规定以及合同双方的真实意思表示。不过，从通常的法律实践和合同约定来看，违约金是更为常见且合法的违约责任承担方式，而滞纳金则更多出现在行政管理领域。
一、违约金与滞纳金的法律属性
违约金：
- 法律属性：违约金是合同当事人在合同中预先约定的，当一方不履行合同义务或履行不符合约定时，应向对方支付的一定数额的金钱。它具有补偿性和一定的惩罚性，旨在弥补守约方因违约行为所遭受的损失，并对违约方进行一定的惩罚。
- 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》第五百八十五条，当事人可以约定一方违约时应当根据违约情况向对方支付一定数额的违约金。这为合同中的违约金条款提供了直接的法律支持。
滞纳金：
- 法律属性：滞纳金通常指行政机关对不按期限履行金钱给付义务的相对人，课以新的金钱给付义务的方法，属于行政强制执行措施之一。它主要适用于行政管理领域，如税收征收、行政处罚等，具有强制性和惩罚性。
- 法律依据：滞纳金的收取依据通常是法律法规的明确规定，而非合同约定。在民事合同中，直接约定滞纳金可能缺乏明确的法律依据，但双方可以借鉴滞纳金的概念，约定类似逾期付款的违约责任。
二、违约金与滞纳金在合同中的适用
违约金在合同中的适用：
- 违约金广泛适用于各类民商事合同，包括工程合同、买卖合同、租赁合同等。双方可以就各种违约情形约定违约金，如工期延误、工程质量不合格、未按约定支付款项等。
- 违约金的数额应合理，不得过高或过低。如果约定的违约金低于造成的损失，人民法院或仲裁机构可以根据当事人的请求予以增加；如果约定的违约金过分高于造成的损失，人民法院或仲裁机构可以根据当事人的请求予以适当减少。
滞纳金在合同中的“变通”适用：
- 由于滞纳金主要适用于行政管理领域，在民事合同中直接约定滞纳金可能缺乏法律依据。但双方可以借鉴滞纳金的概念，约定类似逾期付款的违约责任，如“逾期付款违约金”或“逾期付款利息”等。
- 这种约定应明确计算方式、适用条件及调整规则，以确保在发生争议时有据可依。同时，应避免与行政法规中的滞纳金混淆，确保其约定符合民商事合同的平等自愿原则。
三、合法性判断的关键因素
无论是违约金还是滞纳金（或其变通形式），在合同中的合法性判断关键在于以下几点：
- 双方的真实意思表示：合同条款应是双方自愿和真实意愿的体现，不存在欺诈、胁迫等情形。
- 合法合规性：合同内容不得违反法律、行政法规的强制性规定，也不得违背公序良俗。
- 数额的合理性：约定的违约金或逾期付款责任应合理，不得过高以至于违反公平原则或相关法律法规。
四、建议与注意事项
- 明确约定条款：在签订合同时，应明确约定违约金或逾期付款责任的数额、计算方式、适用条件及调整规则等，以避免后续争议。
- 合理确定数额：在设定违约金或逾期付款责任时，应合理确定数额或计算方法，避免过高或过低导致不公平。
- 及时寻求法律援助：如遇合同纠纷，应及时寻求法律途径解决，通过协商、调解、仲裁或诉讼等方式维护自身合法权益。
总结来说，在合同中约定违约金是更为常见且合法的做法。如果双方希望约定类似滞纳金的逾期付款责任，应明确其非行政性质，并合理确定数额和计算方式。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。