结论：车辆警报灯亮起停在应急车道是否违法，需根据具体情况判断，若因车辆故障等紧急情况且按规定操作则不违法；若非紧急情况或未按规定操作则违法。以下从不同角度详细分析：
一、紧急情况下的合法停车
法律依据：
- 根据《中华人民共和国道路交通安全法》第五十二条及第六十八条的规定，机动车在高速公路上发生故障时，警告标志应当设置在故障车来车方向一百五十米以外，车上人员应当迅速转移到右侧路肩上或者应急车道内，并且迅速报警。同时，机动车在高速公路上发生故障或者交通事故，无法正常行驶的，应当由救援车、清障车拖曳、牵引。
合法条件：
- 车辆故障：车辆因故障无法继续行驶，如发动机故障、轮胎爆裂等。
- 设置警告标志：在故障车来车方向一百五十米以外设置警告标志，以提醒其他车辆注意。
- 人员转移：车上人员应迅速转移到右侧路肩上或者应急车道内，确保人身安全。
- 报警求助：及时报警，等待救援或清障车到来。
示例：
- 若车辆在行驶过程中突然发生故障，如发动机熄火、轮胎爆裂等，导致无法继续行驶，此时驾驶员将车辆停在应急车道，并按照规定设置警告标志、转移人员、报警求助，则这种行为是合法的。
二、非紧急情况下的违法停车
法律依据：
- 同样根据《中华人民共和国道路交通安全法》的相关规定，非紧急情况下在应急车道上停车属于违法行为。应急车道是专门供工程救险、消防救援、医疗救护或民警执行紧急公务等处理应急事务的车辆使用的，任何社会车辆禁止驶入或者以各种理由在车道内停留。
违法条件：
- 非紧急情况：车辆并非因故障或交通事故等紧急情况而停车。
- 未按规定操作：即使因紧急情况停车，但未设置警告标志、未转移人员或未报警求助等，也可能构成违法。
示例：
- 若车辆在行驶过程中，驾驶员因个人原因（如接打电话、查看导航等）将车辆停在应急车道，且未设置警告标志、未转移人员或未报警求助，则这种行为是违法的。
三、法律后果
罚款：
- 根据《中华人民共和国道路交通安全法》第九十条的规定，机动车驾驶人违反道路交通安全法律、法规关于道路通行规定的，处警告或者二十元以上二百元以下罚款。因此，非紧急情况下在应急车道上停车，驾驶员可能面临罚款的处罚。
扣分：
- 根据《道路交通安全违法行为记分管理办法》的相关规定，驾驶机动车在高速公路或者城市快速路上违法停车的，一次记9分。因此，非紧急情况下在应急车道上停车，驾驶员还可能面临扣分的处罚。
建议：作为驾驶员，应严格遵守交通法规，非紧急情况下不得在应急车道上停车。若因车辆故障等紧急情况需要停车，应按照规定设置警告标志、转移人员并报警求助，以确保自身和他人的安全。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。