在轻伤二级且犯罪嫌疑人已取得谅解书的案件中，公安机关、检察院以及法院的处理流程会综合考虑多方面因素，以下是对此问题的详细解答：
一、公安机关的处理建议
公安机关在接到轻伤二级案件后，会进行初步的调查和取证工作。如果了解到双方已经达成和解，并且犯罪嫌疑人已经取得了受害人的谅解书，公安机关有权根据《刑事诉讼法》的相关规定，向人民检察院提出从宽处理的建议。这一建议旨在促进双方的和解，化解社会矛盾，同时也是对犯罪嫌疑人悔罪态度的一种认可。
二、检察院的审查与处理方式
全面审查案件材料：
- 检察院在收到公安机关移送的案件后，会全面审查案件材料，包括伤情鉴定结果、犯罪嫌疑人的行为性质、情节严重程度，以及谅解书等。
考虑谅解书因素：
- 谅解书是受害人向犯罪嫌疑人出具的表示谅解的文件，它表明受害人已经原谅了犯罪嫌疑人的过错，并请求从轻处理。检察院在审查案件时，会将谅解书作为量刑的一个重要参考因素。
作出处理决定：
- 如果检察院认为犯罪情节轻微，且犯罪嫌疑人已取得受害人谅解，根据《刑事诉讼法》的相关规定，可能会作出不起诉决定。这包括法定不起诉、酌定不起诉或证据不足不起诉等情形。
- 如果检察院认为案件需要提起公诉，但考虑到谅解书等因素，可能会在起诉书中提出从轻量刑的建议，如降低刑期、适用缓刑或非监禁刑等。
三、法院的审理与裁决
审理案件：
- 人民法院在收到检察院的起诉书后，会依法对案件进行审理。在审理过程中，法院会充分考虑检察院的量刑建议以及案件的具体情况。
作出裁决：
- 法院会根据犯罪嫌疑人的犯罪情节、悔罪表现、谅解书等因素，对被告人作出相应的判决。如果法院认为被告人符合从宽处罚的条件，可能会判处较轻的刑罚或适用缓刑等。
四、谅解书的作用与意义
谅解书在轻伤二级案件中具有重要作用。它不仅是犯罪嫌疑人悔罪态度的一种体现，也是双方和解的重要证明。在量刑时，法院会充分考虑谅解书的存在，对被告人作出从宽处罚的判决。这有助于促进社会的和谐与稳定，体现法律的人文关怀和社会效果。
五、特殊情况的处理
- 附条件不起诉（针对未成年人）：如果犯罪嫌疑人是未成年人，且符合一定条件（如犯罪情节较轻、有悔罪表现等），检察院可以作出附条件不起诉的决定。在考验期内，未成年人需遵守相关规定，考验期届满后，根据其表现决定是否最终不起诉。
- 退回补充侦查：如果案件存在事实不清、证据不足的情况，即使取得了谅解书，检察院也可能将案件退回公安机关补充侦查，以完善证据链条，准确认定案件事实。
综上所述，在轻伤二级且取得谅解书的案件中，公安机关、检察院和法院会综合考虑多方面因素，包括犯罪情节、悔罪表现、谅解情况等，以实现法律效果和社会效果的统一。这一处理流程既体现了法律的严肃性，也体现了人文关怀和社会和谐的理念。