药店因虚开发票行为将面临行政处罚和刑事处罚，具体处罚视情节严重程度而定。以下从行政和刑事两个角度展开说明：

1. 行政处罚
   根据《中华人民共和国发票管理办法》第三十五条，药店若存在虚开发票（包括为他人、为自己开具与实际经营业务情况不符的发票，或让他人为自己开具此类发票）的行为，税务机关将责令其改正，并可处以5万元以上50万元以下罚款；若情节严重（如多次虚开、虚开金额巨大等），还可能面临吊销营业执照的行政处罚。此外，药店需补缴因虚开发票导致的税款差额，并可能被加收滞纳金。

2. 刑事处罚
   若虚开发票行为涉及金额较大或情节严重，可能构成刑事犯罪。根据《中华人民共和国刑法》第二百零五条：

   • 虚开增值税专用发票罪：若药店虚开的是增值税专用发票，且虚开税款数额在10万元以上，或造成国家税款损失5万元以上，将面临三年以下有期徒刑或拘役，并处2万元以上20万元以下罚金；若虚开税款数额巨大（如50万元以上）或造成特别严重后果（如国家税款损失25万元以上），则可能被判处三年以上十年以下有期徒刑，并处5万元以上50万元以下罚金。
     
   • 虚开发票罪：若虚开的是普通发票（如增值税普通发票），且虚开金额在40万元以上，或虚开发票100份以上，或5年内因虚开发票受过行政处罚2次以上又虚开的，将面临二年以下有期徒刑、拘役或管制，并处或单处2万元以上20万元以下罚金；情节特别严重的（如虚开金额巨大或造成严重后果），可能被判处二年以上七年以下有期徒刑，并处5万元以上50万元以下罚金。

建议：若药店涉及虚开发票行为，应立即停止违法行为，主动向税务机关说明情况并配合调查，争取从轻或减轻处罚。若已面临行政处罚或刑事指控，建议尽快委托专业律师介入，通过法律程序维护合法权益。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体法律问题。