水利工程过程资料中的自检合同并非必须签订独立合同，但需根据具体情况判断是否需要书面形式或纳入主合同条款。以下从不同角度展开分析：

1. 法律强制性要求角度
   根据《民法典》第四百七十条，合同形式分为书面、口头或其他形式。水利工程自检行为若属于主合同（如施工合同、监理合同）的附随义务（例如施工方对自身工程质量的自查义务），则无需单独签订自检合同，可通过主合同中的质量保证条款、验收条款等明确双方权利义务。但若自检行为具有独立性（如第三方检测机构受委托进行专项自检），则建议签订书面合同以明确检测范围、标准、费用及责任划分，避免口头约定的举证风险。

2. 行业规范与实务惯例角度
   水利行业对过程资料有严格管理要求（如《水利工程建设项目档案管理规定》）。自检资料作为工程验收的必备文件，其真实性与完整性需通过合同条款或书面文件保障。例如：

   • 若自检由施工方自行完成，需在施工合同中约定自检程序、频次及资料提交要求；
     
   • 若委托第三方检测，则必须签订检测合同，明确检测方法、报告格式及违约责任，否则可能因资料瑕疵导致验收延误或行政处罚。

3. 风险防控角度
   未签订书面自检合同可能引发以下风险：

   • 责任模糊：自检结果争议时，无法通过合同条款界定是施工方、检测方还是建设方的责任；
     
   • 证据缺失：口头约定难以证明自检标准、范围等关键要素，可能导致举证不利；
     
   • 合规风险：水利工程涉及公共安全，监管部门可能要求自检过程可追溯，书面合同是重要证明材料。

建议：

• 若自检是主合同义务的一部分，可通过补充协议或主合同附件明确细节；
  
• 若涉及第三方检测或专项自检，务必签订书面合同，并重点约定检测标准、报告时效、违约赔偿等条款；
  
• 无论是否签订独立合同，均需保留自检原始记录（如检测数据、影像资料）作为过程证据。
  

如有具体合同文本或场景需要分析，可直接向我提供细节，我会进一步结合法律条文与实务经验为您解读。