结论前置：在已确定林地被破坏但尚未确定违法主体的情况下，执法机关是可以进行立案调查的。

详细分析：

1. 立案调查的法律依据：

   • 根据我国相关法律法规，执法机关在发现违法行为或疑似违法行为时，有权进行立案调查。这一权力是执法机关履行职责、维护公共利益和社会秩序的重要手段。在林地被破坏的情况下，无论违法主体是否确定，执法机关都有责任对事件进行调查，以查明事实真相，保护生态环境。

2. 立案调查的目的：

   • 立案调查的主要目的是查明违法事实，确定违法主体，并依法进行处罚。在林地被破坏的案件中，即使违法主体暂时不明确，执法机关也可以通过调查收集证据，逐步缩小嫌疑范围，最终确定违法主体。因此，立案调查并不依赖于违法主体的明确性。

3. 立案调查的程序：

   • 执法机关在立案调查时，会遵循一定的程序。这通常包括接收报案或举报、初步审查、决定立案、开展调查、收集证据、询问当事人等步骤。在林地被破坏的案件中，执法机关会首先对现场进行勘查，收集相关证据，如破坏痕迹、工具等。同时，他们也会询问周边居民或目击者，以获取更多线索。

4. 违法主体不确定时的处理：

   • 如果在调查过程中，执法机关暂时无法确定违法主体，他们不会因此放弃调查。相反，他们会继续深入调查，扩大线索范围，甚至可能请求其他部门或机构的协助。在必要时，执法机关还可以发布悬赏通告，鼓励公众提供线索，以帮助确定违法主体。

5. 法律后果与责任：

   • 一旦违法主体被确定，执法机关将依法对其进行处罚。处罚措施可能包括罚款、恢复原状、赔偿损失等。如果违法行为构成犯罪，执法机关还将依法追究其刑事责任。因此，即使违法主体暂时不明确，也不影响执法机关对案件的立案调查和后续处理。

建议与提醒：

• 如果您是林地被破坏的受害者或目击者，建议您及时向当地执法机关报案，并提供尽可能多的线索和证据，以协助执法机关尽快查明事实真相。
• 如果您对执法机关的立案调查程序或处理结果有疑问或不满，您可以依法向上级执法机关或相关部门提出申诉或投诉。

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